More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0412 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0438  seryl-tRNA synthetase  98.78 
 
 
411 aa  834    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0412  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
411 aa  844    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.782708  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0533  seryl-tRNA synthetase  83.94 
 
 
411 aa  717    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1569  seryl-tRNA synthetase  97.81 
 
 
411 aa  829    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1189  seryl-tRNA synthetase  65.78 
 
 
414 aa  570  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1756  seryl-tRNA synthetase  65.78 
 
 
414 aa  564  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0773  seryl-tRNA synthetase  65.54 
 
 
414 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.749517  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1342  seryl-tRNA synthetase  64.58 
 
 
414 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0210  seryl-tRNA synthetase  65.23 
 
 
417 aa  550  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.332279  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1667  seryl-tRNA synthetase  60.48 
 
 
415 aa  500  1e-140  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
427 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
423 aa  409  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
426 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
428 aa  398  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
427 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
424 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  45.58 
 
 
438 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
424 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  48.45 
 
 
425 aa  394  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
424 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
426 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  47.62 
 
 
426 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
423 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
428 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
439 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
422 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
428 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
432 aa  395  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
431 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
426 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2772  seryl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
442 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
433 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
430 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
430 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
428 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
438 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
433 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
428 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
433 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2593  seryl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
430 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3445  seryl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
442 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
433 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
428 aa  388  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
427 aa  391  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
428 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
433 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
426 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
428 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  47.54 
 
 
432 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
426 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
428 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
428 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
433 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
433 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
433 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
428 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
428 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
433 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
428 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
426 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
438 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3994  seryl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
435 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
428 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
438 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
428 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
428 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
433 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2535  seryl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
426 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0771698  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  48.69 
 
 
424 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
431 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
433 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1477  seryl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
426 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
426 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
433 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
422 aa  386  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
430 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  46.63 
 
 
422 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
422 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  49.04 
 
 
420 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1402  seryl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
426 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
428 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0692  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
431 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
433 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1990  seryl-tRNA synthetase  46.96 
 
 
431 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3853  seryl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
435 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
433 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
432 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0957  seryl-tRNA synthetase  44.73 
 
 
433 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
422 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4028  seryl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
443 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
433 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
433 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
430 aa  378  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
430 aa  378  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06242  seryl-tRNA synthetase  44.57 
 
 
449 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13316  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
427 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
430 aa  378  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01077  seryl-tRNA synthetase  44.57 
 
 
449 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>