More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3994 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3978  seryl-tRNA synthetase  84.83 
 
 
463 aa  754    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0426777  normal  0.873279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3916  seryl-tRNA synthetase  97.93 
 
 
435 aa  879    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3853  seryl-tRNA synthetase  97.7 
 
 
435 aa  875    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3994  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
435 aa  895    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
424 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
424 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
424 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
424 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
424 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
424 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  55.4 
 
 
424 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
424 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
424 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
424 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  54.98 
 
 
424 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  54.98 
 
 
424 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  53.41 
 
 
425 aa  464  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  54.44 
 
 
422 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  56.07 
 
 
423 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  54.21 
 
 
422 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  54.65 
 
 
432 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
423 aa  457  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  53.1 
 
 
420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  52.8 
 
 
427 aa  450  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  52.47 
 
 
425 aa  449  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
423 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  53.15 
 
 
427 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  53.29 
 
 
424 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  52.58 
 
 
423 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  51.87 
 
 
423 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  53.38 
 
 
425 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  52.67 
 
 
427 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  51.05 
 
 
427 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
422 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
424 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  51.64 
 
 
425 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  52.48 
 
 
427 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  51.4 
 
 
424 aa  431  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
422 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
424 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  51.28 
 
 
421 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  51.28 
 
 
421 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
430 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
427 aa  425  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  52.38 
 
 
423 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
425 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1971  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.140828  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
427 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4414  seryl-tRNA synthetase  51.11 
 
 
442 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.866176  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
427 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
427 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
423 aa  415  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
417 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  50.46 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
425 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
442 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3185  seryl-tRNA synthetase  51.25 
 
 
434 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
421 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
423 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
423 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
431 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
469 aa  415  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  48.38 
 
 
433 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1167  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
427 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0695975  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
424 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
431 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
433 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1490  seryl-tRNA synthetase  52.17 
 
 
427 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.693524  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
433 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2742  seryl-tRNA synthetase  47.62 
 
 
476 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51517  normal  0.290109 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
432 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2787  seryl-tRNA synthetase  50.9 
 
 
434 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  48.38 
 
 
433 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  48.38 
 
 
433 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
426 aa  408  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
436 aa  411  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  48.38 
 
 
433 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  52.32 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  48.15 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 
426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 
426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2535  seryl-tRNA synthetase  51.63 
 
 
426 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0771698  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
433 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
433 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
433 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
433 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
433 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
433 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
433 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1791  seryl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
470 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.419973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3030  seryl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
435 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134958  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
433 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
424 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
424 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1503  seryl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
424 aa  403  1e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>