More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1189 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1189  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 414 aa  851    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0773  seryl-tRNA synthetase  80.43 
 
 		 414 aa  700    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.749517  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1342  seryl-tRNA synthetase  77.05 
 
 		 414 aa  681    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0210  seryl-tRNA synthetase  68.59 
 
 		 417 aa  595  1e-169  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.332279  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0533  seryl-tRNA synthetase  66.99 
 
 		 411 aa  578  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0412  seryl-tRNA synthetase  65.78 
 
 		 411 aa  570  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.782708  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1756  seryl-tRNA synthetase  63.77 
 
 		 414 aa  569  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1569  seryl-tRNA synthetase  65.3 
 
 		 411 aa  567  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0438  seryl-tRNA synthetase  65.54 
 
 		 411 aa  564  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1667  seryl-tRNA synthetase  62.08 
 
 		 415 aa  536  1e-151  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 417 aa  438  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1547  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2535  seryl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0771698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 422 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 426 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 428 aa  408  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 426 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 421 aa  409  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06242  seryl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13316  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 427 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01077  seryl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256687  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0968  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2755  seryl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 426 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958971  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 428 aa  405  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1666  seryl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.746595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1850  seryl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 428 aa  403  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1077  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 430 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1028  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1417  seryl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 469 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 423 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1477  seryl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 426 aa  401  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1402  seryl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  48.83 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 427 aa  396  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 428 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 426 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1990  seryl-tRNA synthetase  49.87 
 
 		 431 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 433 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 423 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 428 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1697  seryl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0685581 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 421 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1075  seryl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0171622  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 428 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 433 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 425 aa  395  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2353  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3404  seryl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 427 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 427 aa  392  1e-108  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 423 aa  392  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 425 aa  394  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>