More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3636 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3636  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 413 aa  862    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000529029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 421 aa  322  5e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 421 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 418 aa  310  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 416 aa  302  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  40.56 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 424 aa  292  7e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 426 aa  292  8e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 423 aa  292  9e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 426 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  38.63 
 
 		 420 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 422 aa  289  7e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 423 aa  289  8e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 436 aa  288  9e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 417 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 424 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 419 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 427 aa  280  4e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 421 aa  280  5e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 422 aa  279  6e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 424 aa  278  9e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 422 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 424 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 425 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 422 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 420 aa  276  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 419 aa  276  5e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 422 aa  276  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 428 aa  276  6e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 427 aa  276  7e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 431 aa  275  8e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 422 aa  275  8e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  35.66 
 
 		 421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 425 aa  273  6e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  35.66 
 
 		 422 aa  272  9e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2307  seryl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000241726  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 427 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 424 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 420 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  36.41 
 
 		 423 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  37.03 
 
 		 426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 424 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 425 aa  266  7e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5133  seryl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 420 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358696  normal  0.0657107 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0349  seryl-tRNA synthetase  37.36 
 
 		 442 aa  263  3e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 411 aa  263  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1289  seryl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265915  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 424 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 422 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13811  seryl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 425 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12751  seryl-tRNA synthetase  35.49 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611136 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 423 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 425 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 426 aa  260  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13891  seryl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 433 aa  259  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 423 aa  259  7e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3523  seryl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 424 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 424 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 424 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 425 aa  257  2e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 424 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 424 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  34.89 
 
 		 423 aa  257  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  34.75 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 424 aa  257  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 424 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 424 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0424  seryl-tRNA synthetase  34.67 
 
 		 427 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 428 aa  256  5e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1382  seryl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 420 aa  256  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.760435  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 424 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 423 aa  255  9e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0934  seryl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.160638  normal  0.296979 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  36.38 
 
 		 427 aa  254  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>