More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5133 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1382  seryl-tRNA synthetase  87.62 
 
 		 420 aa  748    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.760435  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5133  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 420 aa  853    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358696  normal  0.0657107 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1830  seryl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 423 aa  414  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1706  seryl-tRNA synthetase  51.55 
 
 		 424 aa  411  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.689506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0934  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.160638  normal  0.296979 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 427 aa  320  3e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0424  seryl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 427 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 421 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2665  seryl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 427 aa  309  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873953  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 424 aa  308  8e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  41 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 423 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 425 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 423 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  41 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 421 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1490  seryl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 427 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.693524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 423 aa  300  4e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 425 aa  299  5e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 422 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 422 aa  296  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 431 aa  293  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 424 aa  293  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 424 aa  292  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 424 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 424 aa  292  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 424 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1167  seryl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 427 aa  292  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0695975  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 423 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 425 aa  290  2e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 422 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1688  seryl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 427 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 424 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 422 aa  290  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 424 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 428 aa  289  7e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 436 aa  289  7e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 424 aa  289  8e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 426 aa  288  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 413 aa  288  1e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  39.05 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1503  seryl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 424 aa  287  2e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000981154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1569  seryl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 411 aa  287  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 427 aa  288  2e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 424 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 420 aa  286  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  36.43 
 
 		 422 aa  286  5e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 425 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 427 aa  285  7e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0438  seryl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 421 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0412  seryl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.782708  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 424 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_516  seryl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 413 aa  282  8.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  36.77 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 424 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  38.5 
 
 		 421 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  38.5 
 
 		 421 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0886  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.609092 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  36.43 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0519  seryl-tRNA synthetase  37.44 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.306862  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 427 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_002936  DET0577  seryl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 413 aa  280  4e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13811  seryl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 427 aa  280  4e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 420 aa  280  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 427 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  39.42 
 
 		 420 aa  279  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 423 aa  279  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 428 aa  279  7e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 424 aa  278  9e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13891  seryl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>