More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_13811 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_13891  seryl-tRNA synthetase  95.53 
 
 		 425 aa  839    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1289  seryl-tRNA synthetase  93.65 
 
 		 425 aa  825    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265915  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13601  seryl-tRNA synthetase  83.25 
 
 		 425 aa  737    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13811  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 425 aa  868    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12751  seryl-tRNA synthetase  60.71 
 
 		 442 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611136 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0573  seryl-tRNA synthetase  55.79 
 
 		 425 aa  541  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1791  seryl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.985996  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06061  seryl-tRNA synthetase  56.03 
 
 		 425 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.152224 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0807  seryl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 426 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16621  seryl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 426 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.897711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 427 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 427 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  54.03 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 426 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 426 aa  464  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3523  seryl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 422 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 427 aa  415  9.999999999999999e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 420 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 422 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 426 aa  413  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 422 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 424 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  46.71 
 
 		 427 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 425 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 425 aa  396  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 426 aa  396  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 421 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 423 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 423 aa  391  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 469 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1036  seryl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 427 aa  388  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1850  seryl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 428 aa  378  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 425 aa  382  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>