More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3186 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  73.6 
 
 
426 aa  653    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  76.87 
 
 
426 aa  687    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
427 aa  876    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  99.77 
 
 
427 aa  874    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  80.56 
 
 
430 aa  737    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  72.43 
 
 
424 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3523  seryl-tRNA synthetase  73.6 
 
 
425 aa  634    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  68.15 
 
 
428 aa  627  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0573  seryl-tRNA synthetase  61.77 
 
 
425 aa  547  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1791  seryl-tRNA synthetase  60.14 
 
 
425 aa  525  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.985996  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06061  seryl-tRNA synthetase  58.78 
 
 
425 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.152224 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12751  seryl-tRNA synthetase  59.91 
 
 
442 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611136 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16621  seryl-tRNA synthetase  56.16 
 
 
426 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.897711  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13891  seryl-tRNA synthetase  52.93 
 
 
425 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0807  seryl-tRNA synthetase  55.45 
 
 
426 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1289  seryl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
425 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265915  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13601  seryl-tRNA synthetase  52.69 
 
 
425 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13811  seryl-tRNA synthetase  52.69 
 
 
425 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  55.04 
 
 
424 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  53.74 
 
 
420 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  51.99 
 
 
421 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  52.96 
 
 
423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  52.58 
 
 
429 aa  442  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  54.44 
 
 
424 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  51.77 
 
 
428 aa  438  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
424 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
424 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
424 aa  435  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 
427 aa  437  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
424 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 
423 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  53.29 
 
 
423 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
424 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
424 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
424 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
424 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
424 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  52.25 
 
 
427 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
424 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  50.83 
 
 
424 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 
424 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
423 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
424 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  52.01 
 
 
425 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
426 aa  428  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
423 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  52.01 
 
 
427 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  51.77 
 
 
427 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
427 aa  431  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  51.28 
 
 
422 aa  428  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 
422 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
427 aa  428  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  52.07 
 
 
423 aa  428  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
427 aa  422  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
432 aa  425  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  51.77 
 
 
417 aa  422  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
423 aa  424  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  48.95 
 
 
426 aa  423  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
422 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
423 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
422 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
422 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 
425 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
421 aa  415  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
425 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
423 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
424 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
422 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
425 aa  413  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  49.05 
 
 
425 aa  412  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
430 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
422 aa  411  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 
428 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 
426 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1036  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  47.28 
 
 
425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  48 
 
 
442 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  47.28 
 
 
425 aa  402  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
425 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
425 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
423 aa  404  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
424 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
426 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
428 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
428 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01800  seryl-tRNA synthetase  49.31 
 
 
435 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 
425 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  48.6 
 
 
430 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1077  seryl-tRNA synthetase  48.6 
 
 
430 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0180  seryl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
456 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  48.6 
 
 
430 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
430 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>