More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06061 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1791  seryl-tRNA synthetase  82.59 
 
 		 425 aa  733    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.985996  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0573  seryl-tRNA synthetase  84 
 
 		 425 aa  743    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06061  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 425 aa  872    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.152224 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12751  seryl-tRNA synthetase  68.71 
 
 		 442 aa  631  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611136 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16621  seryl-tRNA synthetase  68.78 
 
 		 426 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.897711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0807  seryl-tRNA synthetase  69.01 
 
 		 426 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  65.56 
 
 		 428 aa  564  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13601  seryl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 425 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13891  seryl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 425 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13811  seryl-tRNA synthetase  56.03 
 
 		 425 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1289  seryl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 425 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265915  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  58.78 
 
 		 427 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  58.55 
 
 		 427 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 430 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 424 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  57.28 
 
 		 426 aa  501  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  56.34 
 
 		 426 aa  497  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3523  seryl-tRNA synthetase  56.91 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 427 aa  418  9.999999999999999e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  48 
 
 		 421 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 427 aa  405  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 424 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 424 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 424 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 423 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2593  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 425 aa  388  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 421 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 422 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1497  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 427 aa  388  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1028  seryl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 425 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 421 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 420 aa  388  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  46.21 
 
 		 427 aa  388  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1077  seryl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0968  seryl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  47.43 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1417  seryl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 424 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1722  seryl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1990  seryl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1075  seryl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0171622  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>