More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_16621 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_16621  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 426 aa  872    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.897711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0807  seryl-tRNA synthetase  99.06 
 
 		 426 aa  865    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12751  seryl-tRNA synthetase  71.13 
 
 		 442 aa  627  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611136 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1791  seryl-tRNA synthetase  69.25 
 
 		 425 aa  617  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.985996  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06061  seryl-tRNA synthetase  68.78 
 
 		 425 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.152224 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0573  seryl-tRNA synthetase  67.84 
 
 		 425 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13891  seryl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 425 aa  524  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13811  seryl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 425 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1289  seryl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 425 aa  521  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265915  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13601  seryl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 425 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  58.81 
 
 		 428 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  56.16 
 
 		 427 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  56.16 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 426 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 426 aa  481  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 424 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3523  seryl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 425 aa  441  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  50.58 
 
 		 427 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 422 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 426 aa  409  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 422 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 422 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 420 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 427 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 422 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 428 aa  395  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 427 aa  398  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 425 aa  398  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 424 aa  388  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  47.18 
 
 		 427 aa  388  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 425 aa  388  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 421 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 421 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1036  seryl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1850  seryl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 432 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2593  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 421 aa  375  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 428 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 422 aa  375  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 428 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1497  seryl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1392  seryl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>