More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0979 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  865    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  61.14 
 
 		 424 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  61.61 
 
 		 424 aa  537  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1426  seryl-tRNA synthetase  59.62 
 
 		 426 aa  524  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  57.93 
 
 		 413 aa  501  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0577  seryl-tRNA synthetase  57.69 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_516  seryl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 422 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 422 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 424 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4342  seryl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 422 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 427 aa  431  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 422 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 424 aa  423  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  425  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 417 aa  424  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 424 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 422 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 430 aa  415  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 421 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  48 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  47.75 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 422 aa  395  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 426 aa  394  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2178  seryl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 430 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0367  seryl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 424 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3030  seryl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13891  seryl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 427 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1764  seryl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  45 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  45.69 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>