More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1706 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1830  seryl-tRNA synthetase  78.91 
 
 		 423 aa  671    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1706  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 424 aa  874    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.689506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0934  seryl-tRNA synthetase  58.31 
 
 		 437 aa  495  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.160638  normal  0.296979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1382  seryl-tRNA synthetase  52.27 
 
 		 420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.760435  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5133  seryl-tRNA synthetase  51.55 
 
 		 420 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358696  normal  0.0657107 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 417 aa  355  6.999999999999999e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 424 aa  335  1e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 421 aa  329  7e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 422 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 425 aa  323  3e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 418 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 431 aa  319  5e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0424  seryl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 427 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 426 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 426 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 421 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1503  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000981154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 426 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 423 aa  311  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 426 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 428 aa  310  4e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 422 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 435 aa  309  6.999999999999999e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 424 aa  308  9e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  39 
 
 		 423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 469 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 427 aa  307  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 434 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 425 aa  305  7e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 435 aa  305  9.000000000000001e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  41 
 
 		 427 aa  303  5.000000000000001e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 421 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 428 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 426 aa  302  9e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0102  seryl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 426 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  39.57 
 
 		 420 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2307  seryl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 422 aa  300  4e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000241726  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 429 aa  300  4e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 431 aa  299  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 423 aa  298  8e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 425 aa  298  9e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 427 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 438 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0440  seryl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 439 aa  296  4e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 432 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 425 aa  296  5e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 435 aa  296  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 428 aa  296  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0886  seryl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 429 aa  296  7e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.609092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 427 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  39.62 
 
 		 427 aa  295  8e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 424 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 424 aa  295  9e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 424 aa  295  9e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 427 aa  295  9e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 424 aa  295  9e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 424 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 424 aa  295  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4753  seryl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 424 aa  293  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_002978  WD0028  seryl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 425 aa  293  5e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 433 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>