More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0934 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0934  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 437 aa  882    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.160638  normal  0.296979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1830  seryl-tRNA synthetase  60.48 
 
 		 423 aa  464  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1706  seryl-tRNA synthetase  58.31 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.689506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1382  seryl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.760435  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5133  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358696  normal  0.0657107 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 424 aa  339  5.9999999999999996e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0424  seryl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  42 
 
 		 417 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 422 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 426 aa  323  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 426 aa  323  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 420 aa  322  8e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 426 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 425 aa  319  7e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 422 aa  318  9e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 426 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 425 aa  318  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 425 aa  318  2e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 427 aa  316  6e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 423 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 426 aa  312  6.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 426 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 423 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 423 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2307  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000241726  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 424 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 423 aa  307  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 425 aa  306  7e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 424 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 421 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  40 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1850  seryl-tRNA synthetase  40 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 428 aa  303  5.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 438 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1756  seryl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 414 aa  302  7.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 426 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 428 aa  302  9e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 423 aa  302  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 427 aa  302  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3404  seryl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 426 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25013 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1503  seryl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000981154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 426 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 436 aa  299  6e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 422 aa  299  7e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0886  seryl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 429 aa  299  7e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.609092 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  40 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 422 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 422 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 438 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  40 
 
 		 423 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 427 aa  296  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 469 aa  296  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 427 aa  296  6e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 427 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 427 aa  295  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1764  seryl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 451 aa  294  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0367  seryl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 459 aa  294  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 427 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 427 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 438 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 425 aa  293  5e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 416 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0533  seryl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 411 aa  292  7e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>