More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0349 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0349  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 442 aa  904    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1952  seryl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 455 aa  422  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1666  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 425 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0408  seryl-tRNA synthetase  47 
 
 		 452 aa  397  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 421 aa  395  1e-108  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1667  seryl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.146167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0528  seryl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 448 aa  378  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.784578  normal  0.0294424 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 425 aa  378  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1802  seryl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 454 aa  376  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1611  seryl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.312271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 427 aa  350  4e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 425 aa  349  7e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 422 aa  347  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 421 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 417 aa  343  4e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 425 aa  342  8e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 427 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 425 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 423 aa  332  6e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 424 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 423 aa  330  4e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 424 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0581  seryl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 429 aa  329  6e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.547336  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0885  seryl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 474 aa  327  3e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 422 aa  323  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 423 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 425 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3486  predicted protein  39.57 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  40.46 
 
 		 427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 425 aa  319  7e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 424 aa  319  7e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05490  serine-tRNA ligase, putative  39.21 
 
 		 461 aa  317  4e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.44988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 424 aa  317  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 426 aa  316  5e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 428 aa  315  7e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 423 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 431 aa  309  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 422 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 422 aa  308  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 422 aa  307  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 427 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 425 aa  306  7e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 421 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 427 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  38 
 
 		 427 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 426 aa  303  6.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 418 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 425 aa  302  7.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 424 aa  302  9e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 411 aa  302  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 430 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1823  seryl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 427 aa  300  3e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 433 aa  299  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 428 aa  299  8e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  37.1 
 
 		 420 aa  299  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1392  seryl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3183  seryl-tRNA synthetase  36.24 
 
 		 425 aa  298  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 432 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 431 aa  298  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>