More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0885 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0885  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 474 aa  975    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1667  seryl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 463 aa  518  1e-146  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.146167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0528  seryl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 448 aa  520  1e-146  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.784578  normal  0.0294424 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1611  seryl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 447 aa  501  1e-141  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.312271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1952  seryl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 455 aa  495  1e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1802  seryl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 454 aa  489  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1666  seryl-tRNA synthetase  54.47 
 
 		 457 aa  486  1e-136  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0408  seryl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 452 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 421 aa  319  6e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0349  seryl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 442 aa  310  5e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 435 aa  269  8.999999999999999e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 425 aa  262  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1115  seryl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 425 aa  261  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 422 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  36.64 
 
 		 417 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 411 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 424 aa  257  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 424 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  36.64 
 
 		 424 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 424 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 424 aa  256  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 424 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 424 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  33.79 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  35.8 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0934  seryl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.160638  normal  0.296979 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0581  seryl-tRNA synthetase  33.11 
 
 		 429 aa  254  3e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.547336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  35.03 
 
 		 418 aa  254  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 425 aa  252  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 428 aa  252  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 428 aa  252  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08867  seryl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05490)  34.68 
 
 		 474 aa  251  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000402833 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3183  seryl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  35 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  35.25 
 
 		 421 aa  250  4e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 425 aa  249  7e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 421 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 423 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  34.44 
 
 		 423 aa  244  3e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  34.4 
 
 		 427 aa  243  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 424 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  34.94 
 
 		 427 aa  242  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 435 aa  241  2.9999999999999997e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 421 aa  239  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  34.39 
 
 		 427 aa  238  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 421 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 421 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 427 aa  238  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02111  seryl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 430 aa  237  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000240259  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 424 aa  236  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 421 aa  236  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30572  predicted protein  32.28 
 
 		 462 aa  234  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 432 aa  233  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 425 aa  233  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77516  Seryl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Serine--tRNA ligase) (SerRS)  33.85 
 
 		 460 aa  233  7.000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.845927  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05490  serine-tRNA ligase, putative  32.41 
 
 		 461 aa  233  8.000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.44988  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 431 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4028  seryl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 443 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 427 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  34.32 
 
 		 431 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  31.94 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 425 aa  231  3e-59  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 423 aa  230  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  32.43 
 
 		 428 aa  229  6e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 426 aa  229  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 430 aa  229  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 430 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 430 aa  229  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 430 aa  229  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 424 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  34.23 
 
 		 430 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 430 aa  229  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 430 aa  229  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>