More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0528 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1802  seryl-tRNA synthetase  84.34 
 
 		 454 aa  765    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1667  seryl-tRNA synthetase  84.49 
 
 		 463 aa  794    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.146167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1611  seryl-tRNA synthetase  85.94 
 
 		 447 aa  795    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.312271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0528  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 448 aa  914    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.784578  normal  0.0294424 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0885  seryl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1952  seryl-tRNA synthetase  56.04 
 
 		 455 aa  514  1e-144  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1666  seryl-tRNA synthetase  56.95 
 
 		 457 aa  508  1e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0408  seryl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 452 aa  434  1e-120  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0349  seryl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 442 aa  364  2e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 425 aa  332  1e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 421 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 425 aa  296  6e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 435 aa  288  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 426 aa  286  7e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 417 aa  283  6.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  36.74 
 
 		 421 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 424 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 421 aa  279  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 427 aa  279  9e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 420 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 427 aa  277  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  35.03 
 
 		 425 aa  276  4e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  35.12 
 
 		 426 aa  276  4e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 428 aa  276  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 428 aa  276  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 424 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 424 aa  273  6e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 424 aa  273  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 424 aa  273  6e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 424 aa  273  6e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 424 aa  272  9e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 424 aa  272  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  37 
 
 		 424 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  36.43 
 
 		 421 aa  271  1e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  36.32 
 
 		 420 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  37 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  36.41 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 427 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0581  seryl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.547336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 425 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 422 aa  265  1e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 424 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  34.79 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0934  seryl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.160638  normal  0.296979 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 425 aa  263  6e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3183  seryl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 425 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 426 aa  262  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 425 aa  261  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  36.78 
 
 		 423 aa  260  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 416 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1115  seryl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 425 aa  260  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 435 aa  259  6e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5133  seryl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 420 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358696  normal  0.0657107 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  36.74 
 
 		 426 aa  258  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  34.4 
 
 		 427 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  35.12 
 
 		 424 aa  256  6e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  37.06 
 
 		 423 aa  256  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  36.18 
 
 		 422 aa  255  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1503  seryl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000981154 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  35.28 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08867  seryl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05490)  35.23 
 
 		 474 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000402833 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0842  seryl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  34.63 
 
 		 430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 427 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3486  predicted protein  36.82 
 
 		 435 aa  253  6e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 423 aa  253  7e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 424 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 425 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 423 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 422 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  35.03 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 425 aa  250  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 428 aa  250  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 426 aa  250  5e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  36.41 
 
 		 417 aa  250  5e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  33.78 
 
 		 436 aa  249  6e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0575  seryl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 426 aa  249  7e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>