More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1952 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1666  seryl-tRNA synthetase  74.39 
 
 		 457 aa  693    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1952  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 455 aa  932    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1667  seryl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 463 aa  526  1e-148  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.146167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0528  seryl-tRNA synthetase  56.04 
 
 		 448 aa  514  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.784578  normal  0.0294424 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1611  seryl-tRNA synthetase  55.34 
 
 		 447 aa  502  1e-141  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.312271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0408  seryl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 452 aa  503  1e-141  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0885  seryl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 474 aa  495  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1802  seryl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 454 aa  494  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0349  seryl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 421 aa  366  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 425 aa  351  1e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 425 aa  347  2e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 422 aa  320  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  40 
 
 		 421 aa  317  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 425 aa  315  8e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 417 aa  310  4e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 425 aa  306  7e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 421 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 424 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 424 aa  302  9e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 424 aa  302  9e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 420 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 423 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 424 aa  299  7e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 426 aa  298  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 426 aa  297  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 427 aa  295  8e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 428 aa  295  9e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 428 aa  295  9e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 425 aa  293  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  37.18 
 
 		 420 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 425 aa  292  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 423 aa  292  7e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  38.48 
 
 		 427 aa  292  9e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 428 aa  292  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 423 aa  292  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 427 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0581  seryl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 429 aa  290  4e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.547336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 422 aa  290  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3183  seryl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 425 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 435 aa  290  5.0000000000000004e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 423 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  36.24 
 
 		 428 aa  289  7e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 422 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 423 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 425 aa  287  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 425 aa  287  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 425 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 424 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 424 aa  286  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 422 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 422 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 425 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 427 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0934  seryl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 437 aa  283  5.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.160638  normal  0.296979 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1115  seryl-tRNA synthetase  37.36 
 
 		 425 aa  282  8.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 427 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 418 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  37.64 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 417 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 421 aa  281  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 424 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 424 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 427 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 430 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  37.44 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 426 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 425 aa  277  3e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0842  seryl-tRNA synthetase  35.94 
 
 		 452 aa  276  4e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>