More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_77516 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_77516  Seryl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Serine--tRNA ligase) (SerRS)  100 
 
 		 460 aa  954    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.845927  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08867  seryl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05490)  61.12 
 
 		 474 aa  578  1e-164  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000402833 
 
 
-
 
NC_006686  CND05490  serine-tRNA ligase, putative  53.65 
 
 		 461 aa  495  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.44988  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3486  predicted protein  49.11 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30572  predicted protein  47.35 
 
 		 462 aa  410  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 425 aa  280  3e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 425 aa  280  5e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0408  seryl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0349  seryl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 442 aa  263  4e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  36.77 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1952  seryl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 455 aa  259  6e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  34.79 
 
 		 421 aa  256  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 426 aa  256  8e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 427 aa  254  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  34.32 
 
 		 430 aa  253  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 427 aa  253  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 424 aa  250  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 428 aa  249  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 426 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1666  seryl-tRNA synthetase  36.28 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 425 aa  246  6e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 427 aa  245  9e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 427 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 426 aa  244  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 422 aa  243  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 421 aa  243  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 426 aa  243  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0528  seryl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 448 aa  242  7.999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.784578  normal  0.0294424 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 423 aa  242  9e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 423 aa  242  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  34.8 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 426 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 426 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 422 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 424 aa  240  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 420 aa  240  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 425 aa  239  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 425 aa  240  5e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 421 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 416 aa  239  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  36.65 
 
 		 424 aa  239  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  36.65 
 
 		 424 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 427 aa  239  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  34.44 
 
 		 445 aa  239  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  36.43 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  35.32 
 
 		 423 aa  239  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 424 aa  239  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1667  seryl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 463 aa  238  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.146167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 427 aa  238  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  34 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 424 aa  237  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 424 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  32.45 
 
 		 428 aa  236  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  32.45 
 
 		 428 aa  236  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 424 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 423 aa  236  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 425 aa  236  7e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0885  seryl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 426 aa  234  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 424 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 428 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 429 aa  233  7.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  35.1 
 
 		 427 aa  233  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 419 aa  233  8.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0842  seryl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 452 aa  232  9e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 426 aa  232  9e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  42 
 
 		 419 aa  232  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  32.48 
 
 		 422 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  34.54 
 
 		 424 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 424 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  35.15 
 
 		 423 aa  232  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 427 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  34.67 
 
 		 417 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0412  seryl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 411 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.782708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  33.56 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 423 aa  230  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 422 aa  230  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 431 aa  230  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 425 aa  229  7e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>