More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_3486 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_3486  predicted protein  100 
 
 
435 aa  905    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08867  seryl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05490)  50.34 
 
 
474 aa  422  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000402833 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77516  Seryl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Serine--tRNA ligase) (SerRS)  48.88 
 
 
460 aa  424  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.845927  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05490  serine-tRNA ligase, putative  47.1 
 
 
461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.44988  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30572  predicted protein  47.57 
 
 
462 aa  399  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0349  seryl-tRNA synthetase  40 
 
 
442 aa  318  1e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
425 aa  306  6e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  38.9 
 
 
425 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
425 aa  301  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
427 aa  299  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
421 aa  299  8e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
425 aa  298  9e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0408  seryl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
452 aa  286  7e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1952  seryl-tRNA synthetase  37.56 
 
 
455 aa  283  5.000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
422 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
424 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
433 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
431 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
425 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
425 aa  270  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
421 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
424 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  34.93 
 
 
432 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  35.16 
 
 
431 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
424 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
424 aa  266  7e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1667  seryl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
463 aa  266  8e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.146167  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
424 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
424 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
424 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
424 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  35 
 
 
433 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  34.72 
 
 
421 aa  265  8.999999999999999e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
424 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
433 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
424 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
424 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
423 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
423 aa  264  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
423 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  36.47 
 
 
427 aa  265  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
433 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
433 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
433 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
433 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
433 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
433 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
433 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  35.99 
 
 
432 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
433 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
426 aa  263  6e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  36.32 
 
 
425 aa  262  6.999999999999999e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
424 aa  262  8e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  36.18 
 
 
429 aa  262  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1611  seryl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
447 aa  261  1e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.312271  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
420 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  35 
 
 
433 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3183  seryl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
425 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
433 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1115  seryl-tRNA synthetase  35.8 
 
 
425 aa  260  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0581  seryl-tRNA synthetase  34.78 
 
 
429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.547336  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
428 aa  259  6e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
426 aa  259  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  34.32 
 
 
433 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  34.32 
 
 
433 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0528  seryl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
448 aa  258  2e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.784578  normal  0.0294424 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1802  seryl-tRNA synthetase  38.5 
 
 
454 aa  257  3e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  34.95 
 
 
428 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
423 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
424 aa  257  3e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  34.95 
 
 
428 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  34.32 
 
 
433 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
425 aa  256  4e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
424 aa  256  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  37.25 
 
 
427 aa  255  8e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl017  seryl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
422 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
425 aa  254  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0692  seryl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
431 aa  254  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  34.47 
 
 
427 aa  253  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
430 aa  252  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
428 aa  252  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
423 aa  252  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
422 aa  250  3e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
425 aa  250  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
435 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  34.02 
 
 
427 aa  249  8e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
424 aa  249  8e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.849075 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1666  seryl-tRNA synthetase  32.82 
 
 
457 aa  249  9e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  32.87 
 
 
428 aa  249  9e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  37.7 
 
 
423 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
426 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  34.63 
 
 
423 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  34.46 
 
 
436 aa  248  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  35.96 
 
 
426 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>