More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl017 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl017  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
422 aa  868    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0839  seryl-tRNA synthetase  63.51 
 
 
422 aa  560  1e-158  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  51.05 
 
 
424 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
424 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
424 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 
425 aa  425  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
424 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
424 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
427 aa  419  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
428 aa  421  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
424 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
424 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
424 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
424 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  47.2 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
424 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
424 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 
421 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  50.36 
 
 
420 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
424 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
424 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
424 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  51.07 
 
 
427 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  49.52 
 
 
417 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
424 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
422 aa  410  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
423 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  48.46 
 
 
422 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  50.48 
 
 
423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
425 aa  402  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
427 aa  404  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
427 aa  402  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  48.84 
 
 
427 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
427 aa  401  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
423 aa  398  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
422 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
422 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
422 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
423 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
435 aa  396  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1503  seryl-tRNA synthetase  47.62 
 
 
424 aa  397  1e-109  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981154 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
423 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
423 aa  393  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
425 aa  393  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
423 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
425 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
435 aa  392  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
430 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf851  seryl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
424 aa  388  1e-107  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  47.2 
 
 
428 aa  389  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
426 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
426 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  46.34 
 
 
423 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
422 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
432 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
424 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
433 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
433 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
433 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
433 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
428 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
431 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
433 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
428 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
433 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
469 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
432 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
433 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
431 aa  388  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
422 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  47.92 
 
 
436 aa  388  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
433 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  45.37 
 
 
430 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
422 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
438 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
424 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
427 aa  385  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
426 aa  383  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
423 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0114  seryl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
418 aa  384  1e-105  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
423 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
427 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
427 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1850  seryl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
428 aa  384  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
421 aa  382  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
428 aa  382  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3916  seryl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
435 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599878  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
424 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
433 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
431 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
433 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
424 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
433 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
428 aa  381  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
430 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
431 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
426 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  48.46 
 
 
425 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  45 
 
 
433 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
433 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>