More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2115 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 426 aa  883    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  52.52 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 427 aa  451  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 424 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 424 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 422 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 424 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 424 aa  428  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 423 aa  428  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 421 aa  427  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 422 aa  422  1e-117  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 421 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 432 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 432 aa  421  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 424 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 425 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 421 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 422 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 425 aa  420  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 423 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 425 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  50.24 
 
 		 427 aa  419  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 438 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  51.77 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 430 aa  415  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 425 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 438 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 422 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 427 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 431 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 423 aa  415  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 428 aa  408  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 426 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 427 aa  411  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 421 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 424 aa  408  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 422 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1036  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 422 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0692  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 431 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 426 aa  403  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 428 aa  405  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 433 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 452 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0953  seryl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 468 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.37183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>