More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01720 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  78.86 
 
 		 426 aa  657    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 422 aa  857    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  79.24 
 
 		 424 aa  666    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  75.3 
 
 		 426 aa  645    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  75.3 
 
 		 423 aa  612  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  69.05 
 
 		 418 aa  580  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  70.17 
 
 		 416 aa  578  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  72.04 
 
 		 431 aa  574  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  68.79 
 
 		 426 aa  570  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  66.19 
 
 		 421 aa  565  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  68.56 
 
 		 426 aa  561  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  68.41 
 
 		 426 aa  549  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  67.14 
 
 		 423 aa  547  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  65.32 
 
 		 420 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  64.78 
 
 		 425 aa  541  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  67.22 
 
 		 421 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  62 
 
 		 428 aa  534  1e-150  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  65.71 
 
 		 420 aa  529  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  66.51 
 
 		 419 aa  529  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  65.08 
 
 		 436 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  61.28 
 
 		 428 aa  523  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  65.33 
 
 		 422 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  65.56 
 
 		 422 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  63.57 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  64.45 
 
 		 445 aa  508  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  64.76 
 
 		 419 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  63.03 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  64.52 
 
 		 417 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  64.29 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  64.29 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  61.23 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  60.33 
 
 		 433 aa  491  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  62.23 
 
 		 420 aa  491  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 424 aa  313  4.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 411 aa  310  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 425 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37135  predicted protein  40.93 
 
 		 502 aa  300  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000503836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 428 aa  300  4e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  38 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  38 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 423 aa  298  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 424 aa  296  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 426 aa  294  3e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 426 aa  293  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 424 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 424 aa  294  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 422 aa  293  4e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 424 aa  293  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 425 aa  293  6e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 424 aa  292  7e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 427 aa  292  7e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 425 aa  292  9e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 424 aa  292  9e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 421 aa  291  2e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 424 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 424 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 427 aa  290  4e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 422 aa  289  6e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 422 aa  289  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 425 aa  287  2e-76  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 426 aa  288  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 423 aa  286  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 423 aa  286  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 424 aa  286  7e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 429 aa  285  8e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 421 aa  285  9e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3636  seryl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000529029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4342  seryl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 427 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 424 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 421 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 423 aa  282  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 421 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0842  seryl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 422 aa  280  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>