231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0749 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0749  type IV pilus prepilin peptidase PilD  100 
 
 
266 aa  519  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.886591  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0971  peptidase A24 N- domain-containing protein  43.97 
 
 
253 aa  199  3e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436062  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1264  peptidase A24 N- domain-containing protein  40.91 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0142406  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0697  saccharopine dehydrogenase  42.35 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0996  peptidase A24A-like  34.81 
 
 
271 aa  155  6e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1126  peptidase A24A domain protein  42.29 
 
 
243 aa  152  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0977  peptidase, A24 family  36.4 
 
 
248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  35.16 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08281  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  34.41 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0910585  hitchhiker  0.0000457532 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1186  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  31.94 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  29.37 
 
 
264 aa  111  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  29.06 
 
 
252 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  27.97 
 
 
263 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  32.47 
 
 
270 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  30.74 
 
 
263 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  28.72 
 
 
270 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  28.72 
 
 
270 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  33.85 
 
 
259 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.73 
 
 
273 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.44 
 
 
247 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1879  peptidase A24A domain protein  48.08 
 
 
258 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.240365  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  33.59 
 
 
247 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  33.59 
 
 
247 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  33.08 
 
 
260 aa  102  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.75 
 
 
281 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  29.39 
 
 
259 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.76 
 
 
269 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  27.81 
 
 
291 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  29.15 
 
 
278 aa  100  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  29.23 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.57 
 
 
299 aa  99.4  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  29.89 
 
 
266 aa  99.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  29.89 
 
 
266 aa  99.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  28.89 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  28.74 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  26.84 
 
 
283 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1189  A24 family peptidase  31.73 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  27.05 
 
 
289 aa  96.3  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  30.11 
 
 
255 aa  96.3  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  30.59 
 
 
246 aa  95.5  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.68 
 
 
265 aa  95.1  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2819  peptidase A24A domain-containing protein  40.5 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194344  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  29.35 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  27.55 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0149  peptidase A24A domain-containing protein  27.41 
 
 
306 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  30.3 
 
 
254 aa  94  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  29.52 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0364  leader peptidase TcpJ  32.38 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.692702  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0374  peptidase A24A-like protein  28.51 
 
 
380 aa  92.4  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  27.17 
 
 
274 aa  92  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  34.11 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  26.34 
 
 
258 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  26.3 
 
 
288 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  25.18 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1591  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  51.95 
 
 
329 aa  90.1  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  30.35 
 
 
267 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  36.89 
 
 
248 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  28.62 
 
 
301 aa  89.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.35 
 
 
290 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0392  peptidase A24A domain protein  36.36 
 
 
372 aa  89.7  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0912  A24 family peptidase  31.45 
 
 
258 aa  89  7e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.659523  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  26.28 
 
 
288 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.69 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  29.32 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  28.62 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0946  peptidase A24A domain-containing protein  38.33 
 
 
387 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  26.5 
 
 
288 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  25.76 
 
 
290 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  43.75 
 
 
261 aa  87  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  26.12 
 
 
290 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  33.33 
 
 
288 aa  87  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0067  prepilin peptidase  29.11 
 
 
299 aa  87  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000398253  normal  0.330687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  26.51 
 
 
300 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  26.52 
 
 
297 aa  87  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  33.88 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  26.5 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  28.52 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  29.58 
 
 
320 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1935  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.69 
 
 
262 aa  86.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.43 
 
 
293 aa  86.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0311  peptidase A24A domain protein  27.31 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0842  A24 family peptidase  32.26 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  28.68 
 
 
274 aa  85.9  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  27 
 
 
257 aa  85.9  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  28.57 
 
 
289 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  35.94 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  24.07 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  27.38 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  26.09 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0538  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  29.02 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1138  peptidase A24A domain-containing protein  30.2 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120004  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  26.22 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1009  peptidase A24A domain-containing protein  29.84 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00230804  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  27.08 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.39 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  26.39 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  26.6 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  25.52 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0992  peptidase A24A domain-containing protein  29.8 
 
 
240 aa  82  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0044171  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  40.79 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.695125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>