230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0977 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0977  peptidase, A24 family  100 
 
 		 248 aa  482  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0971  peptidase A24 N- domain-containing protein  36.69 
 
 		 253 aa  148  8e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436062  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1189  A24 family peptidase  42.04 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0912  A24 family peptidase  42 
 
 		 258 aa  141  8e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.659523  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0842  A24 family peptidase  42.4 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0749  type IV pilus prepilin peptidase PilD  36.4 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.886591  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1264  peptidase A24 N- domain-containing protein  33.6 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0142406  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0996  peptidase A24A-like  31.66 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  36.14 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1126  peptidase A24A domain protein  33.2 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0697  saccharopine dehydrogenase  34.24 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  31.25 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  48.91 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  28.69 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  32.37 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2819  peptidase A24A domain-containing protein  40.52 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  29.96 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  32.43 
 
 		 278 aa  95.1  9e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  28.81 
 
 		 252 aa  94.4  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  32.49 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.29 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  32.49 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  28.87 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  44.86 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.32 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  31.56 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  35.77 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  29.1 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  30.52 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1221  peptidase A24A domain-containing protein  32.37 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.544367  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  29.49 
 
 		 266 aa  89.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  29.49 
 
 		 266 aa  89.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  28.93 
 
 		 267 aa  88.6  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1879  peptidase A24A domain protein  31.08 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.240365  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0392  peptidase A24A domain protein  41.44 
 
 		 372 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.21 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  32.55 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  28.63 
 
 		 273 aa  87.8  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.49 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1357  late competence protein comC  33.47 
 
 		 240 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1186  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  45.28 
 
 		 282 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  42.59 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  29.1 
 
 		 259 aa  85.5  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  28.3 
 
 		 283 aa  85.5  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  30.65 
 
 		 274 aa  85.5  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  28.74 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3987  late competence protein comC  31.78 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08281  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  39.2 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0910585  hitchhiker  0.0000457532 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  30.2 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1219  late competence protein comC  30.71 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1395  late competence protein comC  30.71 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1318  late competence protein comC  30.71 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  33.04 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  26.14 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.93 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  29.96 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.51 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1459  late competence protein comC  30.96 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1419  late competence protein comC  30.71 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1197  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  30.71 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1199  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  30.71 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  27.95 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1489  peptidase A24A domain-containing protein  29.17 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  28.63 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  27.05 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0311  peptidase A24A domain protein  44.87 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  25.76 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.02 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  27.04 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  41.18 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0946  peptidase A24A domain-containing protein  35.65 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02841  bifunctional prepilin leader peptidase/ methylase  28.74 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02791  hypothetical protein  28.74 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000841079  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1037  peptidase A24A domain protein  30.16 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.869777 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  33.33 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  27.98 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0724  Acid phosphatase  28.35 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0244  peptidase A24A domain protein  31.86 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  27.64 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2090  peptidase A24A domain protein  30.16 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  39.25 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  33.63 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3430  type IV prepilin peptidase family protein  27.97 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0671  peptidase A24A domain protein  25.94 
 
 		 299 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1795  peptidase A24A domain-containing protein  31.44 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  31.54 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.04 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0637  prepilin peptidase  37.93 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  25.9 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0671  peptidase A24A domain protein  25.94 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0992  peptidase A24A domain-containing protein  38 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0044171  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  26.32 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1591  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  44.3 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0374  peptidase A24A-like protein  36.96 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  26.5 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  25.32 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1138  peptidase A24A domain-containing protein  37.37 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120004  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  26.86 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  31.01 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  26.86 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>