220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1489 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1489  peptidase A24A domain-containing protein  100 
 
 
224 aa  440  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  29.11 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  29.11 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  33.19 
 
 
259 aa  85.9  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0971  peptidase A24 N- domain-containing protein  30.57 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436062  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  29.92 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1009  peptidase A24A domain-containing protein  34.56 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00230804  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  29.91 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.49 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  28.27 
 
 
259 aa  79  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.63 
 
 
247 aa  79  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  27.89 
 
 
260 aa  79  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0977  peptidase, A24 family  29.17 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1879  peptidase A24A domain protein  25.99 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.240365  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08281  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  45.78 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0910585  hitchhiker  0.0000457532 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2819  peptidase A24A domain-containing protein  33.93 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194344  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  27.75 
 
 
248 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2090  peptidase A24A domain protein  31.86 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  31.47 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  25.1 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  28.76 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  27.75 
 
 
253 aa  72  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  27.6 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1126  peptidase A24A domain protein  32.73 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  28 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0311  peptidase A24A domain protein  38.82 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  40.23 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  45.45 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  31.42 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  29.79 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1795  peptidase A24A domain-containing protein  28.99 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  28.1 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  25.54 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0697  saccharopine dehydrogenase  42.11 
 
 
262 aa  67  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1186  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  41.25 
 
 
282 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  27.97 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  28.45 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1037  peptidase A24A domain protein  44.12 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.869777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.46 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.58 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.38 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1264  peptidase A24 N- domain-containing protein  35.29 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0142406  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0996  peptidase A24A-like  41.77 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  41.77 
 
 
273 aa  65.1  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  28.81 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1138  peptidase A24A domain-containing protein  27.22 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120004  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0392  peptidase A24A domain protein  34.48 
 
 
372 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.84 
 
 
287 aa  65.1  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  28.74 
 
 
278 aa  64.3  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  26.29 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1591  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.2 
 
 
329 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0149  peptidase A24A domain-containing protein  29.63 
 
 
306 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0992  peptidase A24A domain-containing protein  32.93 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0044171  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  26.72 
 
 
266 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  27.43 
 
 
260 aa  63.2  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  26.72 
 
 
266 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  27.48 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  26.48 
 
 
291 aa  62.8  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  26.92 
 
 
248 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  34.34 
 
 
288 aa  62.4  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  25.47 
 
 
287 aa  62.4  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  26.2 
 
 
257 aa  62.4  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  22.54 
 
 
274 aa  62  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  26.61 
 
 
295 aa  61.6  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  27.73 
 
 
263 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.97 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0946  peptidase A24A domain-containing protein  35.14 
 
 
387 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  25.55 
 
 
254 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  25.68 
 
 
291 aa  59.3  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0186  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  31.6 
 
 
219 aa  59.3  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.09 
 
 
299 aa  58.9  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  26.42 
 
 
283 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  25.35 
 
 
320 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  37.5 
 
 
255 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1561  peptidase A24A domain protein  28.33 
 
 
261 aa  58.5  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0861  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  25 
 
 
298 aa  58.2  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0046  peptidase A24A domain protein  32.47 
 
 
297 aa  58.5  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.967031  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  26.64 
 
 
303 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  35.71 
 
 
261 aa  57.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  31.46 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1753  peptidase A24A domain-containing protein  28.8 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.262609  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1719  peptidase A24A domain-containing protein  28.8 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0749  type IV pilus prepilin peptidase PilD  37.66 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.886591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1134  type IV pilus prepilin peptidase PilD  35.71 
 
 
351 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  25.3 
 
 
296 aa  56.6  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  31.94 
 
 
293 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  25.82 
 
 
308 aa  56.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1219  late competence protein comC  30.09 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1199  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  39.74 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0244  peptidase A24A domain protein  26.13 
 
 
239 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1318  late competence protein comC  30.09 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  35.9 
 
 
267 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1395  late competence protein comC  30.09 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  40.24 
 
 
300 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  39.24 
 
 
270 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1197  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  39.74 
 
 
240 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  26.95 
 
 
305 aa  55.8  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  39.24 
 
 
270 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  41.82 
 
 
309 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0067  prepilin peptidase  26.62 
 
 
299 aa  55.5  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000398253  normal  0.330687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>