100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0251 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_0251  DNA-binding protein  100 
 
 		 149 aa  290  6e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000057612  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1943  DNA-binding protein BpH2  98.66 
 
 		 149 aa  284  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773845  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0581  DNA-binding protein BpH2  65.79 
 
 		 129 aa  156  7e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1603  DNA-binding protein  65.79 
 
 		 129 aa  156  7e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.53335  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0911  DNA-binding protein HU, putative  58.65 
 
 		 135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000732094  decreased coverage  0.000000096145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2924  histone family protein DNA-binding protein  56.84 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0054  histone family protein DNA-binding protein  54.55 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.905154  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1452  histone-like DNA-binding protein  54.74 
 
 		 99 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4034  DNA-binding protein HU  52.53 
 
 		 100 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.235716 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1203  histone-like DNA-binding protein  54.74 
 
 		 99 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3750  histone-like DNA-binding protein  49.47 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0653422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5992  histone-like DNA-binding protein  50.53 
 
 		 202 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0701  DNA-binding protein BpH2  49.5 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01988  DNA-binding protein  46.46 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.864367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1500  histone family protein DNA-binding protein  49.47 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0444762  normal  0.010023 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5164  histone family protein DNA-binding protein  49.47 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1589  histone family protein DNA-binding protein  49.46 
 
 		 179 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5558  histone-like DNA-binding protein  49.47 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5068  histone family protein DNA-binding protein  47.47 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3872  histone family protein DNA-binding protein  51.58 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1029  histone-like protein  44.44 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.221489  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1007  histone family protein DNA-binding protein  50.54 
 
 		 132 aa  84.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.402804 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0905  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7384  histone family protein DNA-binding protein  47.71 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.283987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2106  histone-like DNA-binding protein  51.58 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4388  histone-like DNA-binding protein  51.58 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.294948  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6191  histone-like DNA-binding protein  46.46 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442446  hitchhiker  0.00020029 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3550  histone family protein DNA-binding protein  51.58 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4742  histone-like DNA-binding protein  49.47 
 
 		 230 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039459  normal  0.060583 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2126  histone family protein DNA-binding protein  49.46 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.598787  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4602  histone family protein DNA-binding protein  48.51 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1700  DNA-binding protein BpH2  48.51 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791918  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0746  DNA-binding protein BpH2  48.51 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.73636  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6090  histone-like bacterial DNA-binding protein (Bph2)  49.47 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000417993  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0551  histone H1  48.51 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2281  putative histone H1  48.51 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2419  putative histone H1  48.51 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1880  DNA-binding protein BpH2  48.51 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1671  DNA-binding protein BpH2  48.51 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.412961  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4051  histone-like DNA-binding protein  48.42 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4509  histone family protein DNA-binding protein  44.76 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0180118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4510  histone family protein DNA-binding protein  42.42 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43063  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0762  Bph2  42.42 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0912566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4442  histone family protein DNA-binding protein  42.42 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3162  histone family protein DNA-binding protein  42.42 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3889  histone family protein DNA-binding protein  42.42 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.933734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2662  histone-like protein  41.41 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.128126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2651  histone family protein DNA-binding protein  39.77 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.532078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0984  histone-like DNA-binding protein  37.89 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12900  putative DNA binding protein  39.77 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3288  DNA-binding protein HU  37.76 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.36981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1168  putative DNA binding protein  39.77 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0082  histone-like DNA-binding protein  38.95 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  38.54 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2947  prophage MuMc02, DNA-binding protein HU  39 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  34.38 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2724  histone-like DNA-binding protein  39.18 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.032856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2301  nucleoid protein Hbs  37.89 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.265465  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2801  histone-like DNA-binding protein  35.71 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0405  histone family protein DNA-binding protein  40.82 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  32.99 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl201  histone-like DNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.25153  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  32.99 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1266  DNA-binding protein HU family  37.66 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4242  histone family protein DNA-binding protein  35.79 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0975  histone family protein DNA-binding protein  37.66 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1717  histone family protein DNA-binding protein  37.89 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000293556  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1013  histone family protein DNA-binding protein  37.66 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0981  histone family protein DNA-binding protein  37.66 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_66  DNA-binding protein HU-alpha  35.11 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1084  histone-like DNA-binding protein  37.66 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26150  nucleoid DNA-binding protein  35.11 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16074  predicted protein  31.87 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.73937  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1892  histone-like DNA-binding protein  36.56 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.127774  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0175  histone-like protein DNA-binding protein  34.69 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3873  histone family protein DNA-binding protein  33.78 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4202  histone family protein DNA-binding protein  35.06 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  35.79 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1976  nucleoid DNA-binding protein  34.69 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3302  histone family protein DNA-binding protein  35.48 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4352  histone family protein DNA-binding protein  32.98 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614172 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4335  histone family protein DNA-binding protein  32.98 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4203  histone-like DNA-binding protein  32.98 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2570  histone-like DNA-binding protein  36.56 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153963  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4358  histone family protein DNA-binding protein  32.98 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.847271  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2223  histone-like DNA-binding protein  36.56 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167078  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2889  histone-like DNA-binding protein  36.56 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  32.99 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  36.46 
 
 		 103 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  33.68 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1701  HU-like DNA-binding protein alpha subunit  35.05 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  33.68 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  35.06 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2397  histone-like DNA-binding protein  36.56 
 
 		 104 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.806116  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0705  DNA-binding protein HU  34.69 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  32.29 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2507  histone family protein DNA-binding protein  36.73 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.748528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  32.99 
 
 		 91 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>