132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1603 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_1603  DNA-binding protein  100 
 
 		 129 aa  255  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.53335  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0581  DNA-binding protein BpH2  100 
 
 		 129 aa  255  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0251  DNA-binding protein  61.72 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000057612  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1943  DNA-binding protein BpH2  60.94 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773845  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0911  DNA-binding protein HU, putative  60.95 
 
 		 135 aa  130  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000732094  decreased coverage  0.000000096145 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0054  histone family protein DNA-binding protein  56.44 
 
 		 106 aa  105  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.905154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4034  DNA-binding protein HU  52.04 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.235716 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2924  histone family protein DNA-binding protein  54.74 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3750  histone-like DNA-binding protein  52.04 
 
 		 99 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0653422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1452  histone-like DNA-binding protein  53.06 
 
 		 99 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14886  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1203  histone-like DNA-binding protein  53.06 
 
 		 99 aa  100  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1029  histone-like protein  50.51 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.221489  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0905  histone family protein DNA-binding protein  50.51 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6191  histone-like DNA-binding protein  49.49 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442446  hitchhiker  0.00020029 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5558  histone-like DNA-binding protein  48.48 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2126  histone family protein DNA-binding protein  49.49 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.598787  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6090  histone-like bacterial DNA-binding protein (Bph2)  49.49 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000417993  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5992  histone-like DNA-binding protein  48.48 
 
 		 202 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01988  DNA-binding protein  45.45 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.864367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1589  histone family protein DNA-binding protein  48.48 
 
 		 179 aa  90.1  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5164  histone family protein DNA-binding protein  46.08 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1007  histone family protein DNA-binding protein  45.45 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.402804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1500  histone family protein DNA-binding protein  46.08 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0444762  normal  0.010023 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4742  histone-like DNA-binding protein  45.45 
 
 		 230 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039459  normal  0.060583 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5068  histone family protein DNA-binding protein  45.45 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4051  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4602  histone family protein DNA-binding protein  43.43 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0701  DNA-binding protein BpH2  42.42 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4442  histone family protein DNA-binding protein  42.57 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3872  histone family protein DNA-binding protein  42.42 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2106  histone-like DNA-binding protein  42.42 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0762  Bph2  42.42 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0912566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4388  histone-like DNA-binding protein  42.42 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.294948  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3550  histone family protein DNA-binding protein  42.42 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108328  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1700  DNA-binding protein BpH2  41.41 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791918  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0746  DNA-binding protein BpH2  41.41 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.73636  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1671  DNA-binding protein BpH2  41.41 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.412961  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1880  DNA-binding protein BpH2  41.41 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2419  putative histone H1  41.41 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2281  putative histone H1  41.41 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0551  histone H1  41.41 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4510  histone family protein DNA-binding protein  41.41 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43063  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4509  histone family protein DNA-binding protein  41.41 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0180118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7384  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.283987 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3889  histone family protein DNA-binding protein  43.43 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.933734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3162  histone family protein DNA-binding protein  43.43 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2662  histone-like protein  38.38 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.128126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0082  histone-like DNA-binding protein  39.18 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4352  histone family protein DNA-binding protein  37.5 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614172 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2651  histone family protein DNA-binding protein  34.74 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.532078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4203  histone-like DNA-binding protein  34.38 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4335  histone family protein DNA-binding protein  34.38 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4358  histone family protein DNA-binding protein  34.38 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.847271  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3288  DNA-binding protein HU  36.08 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.36981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  33.67 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  32.65 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0984  histone-like DNA-binding protein  31.96 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4242  histone family protein DNA-binding protein  34.02 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0975  histone family protein DNA-binding protein  34.02 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0313  DNA-binding protein, HU  31.96 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.657113  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  35.71 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1013  histone family protein DNA-binding protein  34.02 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1168  putative DNA binding protein  31.96 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0981  histone family protein DNA-binding protein  34.02 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10570  histone family protein DNA-binding protein  36.54 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12900  putative DNA binding protein  30.93 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1633  histone family protein DNA-binding protein  32.65 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1956  nucleoid protein Hbs  33.67 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.582961  normal  0.45981 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  36.08 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  34.02 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1266  DNA-binding protein HU family  31.96 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2801  histone-like DNA-binding protein  35.05 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  33.33 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3873  histone family protein DNA-binding protein  39.74 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  32.99 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2795  histone family protein DNA-binding protein  34.02 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  33.33 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  34.02 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0506  histone family protein DNA-binding protein  36.17 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424528 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1084  histone-like DNA-binding protein  31.96 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1388  DNA-binding protein HU, form N  34.02 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082303  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0055  histone family protein DNA-binding protein  34.02 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0808808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0867  histone family protein DNA-binding protein  37.89 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  2.6253e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  32.99 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  31.63 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1584  DNA-binding protein HU family protein  30.93 
 
 		 91 aa  42.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000100307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1789  histone family protein DNA-binding protein  30.61 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  32.65 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  32.65 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1892  histone-like DNA-binding protein  37.86 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.127774  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  32.29 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  37.37 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1294  histone family protein DNA-binding protein  30.93 
 
 		 91 aa  42.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000180262  unclonable  0.000000000020236 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2570  histone-like DNA-binding protein  39.18 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153963  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2397  histone-like DNA-binding protein  38.71 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.806116  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3065  nucleoid protein Hbs  31.63 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135138  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2301  nucleoid protein Hbs  30.93 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.265465  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4202  histone family protein DNA-binding protein  34.18 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  31.96 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>