54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3162 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3162  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 139 aa  256  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3889  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 139 aa  256  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.933734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4510  histone family protein DNA-binding protein  90.2 
 
 		 155 aa  184  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43063  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4509  histone family protein DNA-binding protein  79.21 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0180118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4602  histone family protein DNA-binding protein  75.25 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0701  DNA-binding protein BpH2  74.26 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4442  histone family protein DNA-binding protein  76.24 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0762  Bph2  76.24 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0912566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4051  histone-like DNA-binding protein  70.59 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1700  DNA-binding protein BpH2  74.26 
 
 		 147 aa  153  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791918  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0746  DNA-binding protein BpH2  74.26 
 
 		 147 aa  153  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.73636  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4388  histone-like DNA-binding protein  75 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.294948  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2281  putative histone H1  74.26 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1671  DNA-binding protein BpH2  74.26 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.412961  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1880  DNA-binding protein BpH2  74.26 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0551  histone H1  74.26 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2419  putative histone H1  74.26 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3550  histone family protein DNA-binding protein  75 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3872  histone family protein DNA-binding protein  75 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2106  histone-like DNA-binding protein  75 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1589  histone family protein DNA-binding protein  65.47 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2126  histone family protein DNA-binding protein  64.75 
 
 		 134 aa  150  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.598787  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4742  histone-like DNA-binding protein  70 
 
 		 230 aa  148  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039459  normal  0.060583 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7384  histone family protein DNA-binding protein  79.05 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.283987 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5068  histone family protein DNA-binding protein  65.71 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1029  histone-like protein  64.55 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.221489  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0905  histone family protein DNA-binding protein  64.55 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5992  histone-like DNA-binding protein  60.78 
 
 		 202 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5164  histone family protein DNA-binding protein  61 
 
 		 130 aa  131  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1500  histone family protein DNA-binding protein  61 
 
 		 130 aa  131  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0444762  normal  0.010023 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5558  histone-like DNA-binding protein  58.82 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6191  histone-like DNA-binding protein  58.82 
 
 		 140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442446  hitchhiker  0.00020029 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6090  histone-like bacterial DNA-binding protein (Bph2)  61 
 
 		 147 aa  130  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000417993  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1007  histone family protein DNA-binding protein  61.76 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.402804 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2662  histone-like protein  69.52 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.128126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01988  DNA-binding protein  54.9 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.864367  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0911  DNA-binding protein HU, putative  45.1 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000732094  decreased coverage  0.000000096145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2924  histone family protein DNA-binding protein  49.46 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0251  DNA-binding protein  38.06 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000057612  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1603  DNA-binding protein  43.43 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.53335  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0581  DNA-binding protein BpH2  43.43 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1943  DNA-binding protein BpH2  38.06 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1203  histone-like DNA-binding protein  41.67 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0054  histone family protein DNA-binding protein  42.42 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.905154  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1452  histone-like DNA-binding protein  41.67 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14886  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3750  histone-like DNA-binding protein  37.11 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0653422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4034  DNA-binding protein HU  36.46 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.235716 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1051  histone family protein DNA-binding protein  34.41 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000497636  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2795  histone family protein DNA-binding protein  35.42 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0082  histone-like DNA-binding protein  36.73 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1388  DNA-binding protein HU, form N  35.42 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082303  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0055  histone family protein DNA-binding protein  35.42 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0808808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3288  DNA-binding protein HU  36.46 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.36981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2801  histone-like DNA-binding protein  36.46 
 
 		 97 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.821949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>