80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene COXBURSA331_A1943 on replicon NC_010117
Organism: Coxiella burnetii RSA 331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1943  DNA-binding protein BpH2  100 
 
 
149 aa  291  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773845  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0251  DNA-binding protein  98.66 
 
 
149 aa  284  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000057612  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0581  DNA-binding protein BpH2  64.91 
 
 
129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1603  DNA-binding protein  64.91 
 
 
129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.53335  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0911  DNA-binding protein HU, putative  57.69 
 
 
135 aa  121  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000732094  decreased coverage  0.000000096145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2924  histone family protein DNA-binding protein  56.84 
 
 
118 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0054  histone family protein DNA-binding protein  53.54 
 
 
106 aa  100  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.905154  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1452  histone-like DNA-binding protein  54.74 
 
 
99 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4034  DNA-binding protein HU  52.53 
 
 
100 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.235716 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1203  histone-like DNA-binding protein  54.74 
 
 
99 aa  95.9  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3750  histone-like DNA-binding protein  49.47 
 
 
99 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0653422  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5558  histone-like DNA-binding protein  49.47 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4742  histone-like DNA-binding protein  49.47 
 
 
230 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039459  normal  0.060583 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5992  histone-like DNA-binding protein  49.47 
 
 
202 aa  84  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6191  histone-like DNA-binding protein  46.46 
 
 
140 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442446  hitchhiker  0.00020029 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6090  histone-like bacterial DNA-binding protein (Bph2)  49.47 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000417993  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4051  histone-like DNA-binding protein  48.42 
 
 
154 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0701  DNA-binding protein BpH2  48.51 
 
 
147 aa  83.6  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01988  DNA-binding protein  45.45 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.864367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1500  histone family protein DNA-binding protein  48.42 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0444762  normal  0.010023 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7384  histone family protein DNA-binding protein  47.71 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.283987 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5164  histone family protein DNA-binding protein  48.42 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1589  histone family protein DNA-binding protein  48.39 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.647783  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5068  histone family protein DNA-binding protein  46.46 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1029  histone-like protein  43.43 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.221489  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0905  histone family protein DNA-binding protein  43.43 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3872  histone family protein DNA-binding protein  50.53 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2126  histone family protein DNA-binding protein  48.39 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.598787  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3550  histone family protein DNA-binding protein  50.53 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108328  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4388  histone-like DNA-binding protein  50.53 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.294948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2106  histone-like DNA-binding protein  50.53 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1007  histone family protein DNA-binding protein  49.46 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.402804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4602  histone family protein DNA-binding protein  47.52 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670627  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0746  DNA-binding protein BpH2  47.52 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.73636  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1700  DNA-binding protein BpH2  47.52 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791918  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2419  putative histone H1  47.52 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0551  histone H1  47.52 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2281  putative histone H1  47.52 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1880  DNA-binding protein BpH2  47.52 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1671  DNA-binding protein BpH2  47.52 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.412961  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4509  histone family protein DNA-binding protein  43.81 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0180118  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4510  histone family protein DNA-binding protein  41.41 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43063  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0762  Bph2  41.41 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0912566  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4442  histone family protein DNA-binding protein  41.41 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3889  histone family protein DNA-binding protein  42.42 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.933734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3162  histone family protein DNA-binding protein  42.42 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2662  histone-like protein  41.41 
 
 
157 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.128126  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2651  histone family protein DNA-binding protein  38.64 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.532078  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  38.54 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0984  histone-like DNA-binding protein  36.84 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12900  putative DNA binding protein  38.64 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1168  putative DNA binding protein  38.64 
 
 
93 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0082  histone-like DNA-binding protein  37.89 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2724  histone-like DNA-binding protein  39.18 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.032856  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  34.38 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl201  histone-like DNA-binding protein  33.33 
 
 
90 aa  47  0.00009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.25153  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0405  histone family protein DNA-binding protein  40.82 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2947  prophage MuMc02, DNA-binding protein HU  38 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2301  nucleoid protein Hbs  36.84 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.265465  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1717  histone family protein DNA-binding protein  37.89 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000293556  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  36.46 
 
 
103 aa  42  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  32.29 
 
 
90 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1266  DNA-binding protein HU family  36.36 
 
 
93 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3873  histone family protein DNA-binding protein  33.78 
 
 
114 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0975  histone family protein DNA-binding protein  36.36 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26150  nucleoid DNA-binding protein  35.11 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4242  histone family protein DNA-binding protein  34.74 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0981  histone family protein DNA-binding protein  36.36 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1013  histone family protein DNA-binding protein  36.36 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1976  nucleoid DNA-binding protein  34.69 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1084  histone-like DNA-binding protein  36.36 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2507  histone family protein DNA-binding protein  36.73 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.748528  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1892  histone-like DNA-binding protein  36.56 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.127774  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  33.68 
 
 
90 aa  40.8  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  33.68 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1988  histone family protein DNA-binding protein  33.68 
 
 
89 aa  40.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_66  DNA-binding protein HU-alpha  34.04 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2223  histone-like DNA-binding protein  36.56 
 
 
99 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0175  histone-like protein DNA-binding protein  33.67 
 
 
116 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0313  DNA-binding protein, HU  31.58 
 
 
92 aa  40  0.01  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.657113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>