More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26150 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_26150  nucleoid DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3371  histone family protein DNA-binding protein  68.13 
 
 		 92 aa  130  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.557134  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2752  histone family protein DNA-binding protein  56.82 
 
 		 93 aa  105  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2507  histone family protein DNA-binding protein  57.95 
 
 		 93 aa  106  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.748528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36290  nucleoid DNA-binding protein  56.82 
 
 		 94 aa  103  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3268  histone family protein DNA-binding protein  55.68 
 
 		 93 aa  103  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0298  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406887  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1976  nucleoid DNA-binding protein  50 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0705  DNA-binding protein HU  48.86 
 
 		 93 aa  92.8  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19160  nucleoid DNA-binding protein  51.69 
 
 		 93 aa  92.8  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34702  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4472  histone family protein DNA-binding protein  45.45 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00595179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3916  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 94 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3718  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  46.67 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  48.89 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  51.16 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0183  DNA-binding protein HU 1  48.89 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000296943  hitchhiker  2.26878e-36 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  48.84 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  47.78 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  51.16 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  48.86 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  48.84 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  46.59 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  47.13 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  47.67 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  46.51 
 
 		 95 aa  76.6  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1900  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.785636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  44.32 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  45.45 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  45.45 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  44.32 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1251  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0902596  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2903  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00933352  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  41.86 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  45.56 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  45.56 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  45.56 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  45.56 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  45.56 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  45.56 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  44.32 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3249  histone-like DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  45.56 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  42.86 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  45.56 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  45.56 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  45.45 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  44.32 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  42.7 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  40.7 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  44.32 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  39.53 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  43.82 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  46.59 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  46.07 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  44.32 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 232 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  39.53 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3512  histone-like DNA-binding protein  42.05 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.848806  normal  0.0177296 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4039  HU family DNA-binding protein  47.73 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4749  histone-like DNA-binding protein  47.73 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  40.91 
 
 		 91 aa  72  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  43.02 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  45.35 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0015  Histone-like DNA-binding protein  46.51 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  44.19 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4958  histone-like DNA-binding protein  43.68 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>