More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3512 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3512  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 99 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.848806  normal  0.0177296 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0007  histone-like DNA-binding protein  69.41 
 
 		 98 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  59.55 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4958  histone-like DNA-binding protein  57.3 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1956  nucleoid protein Hbs  59.55 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.582961  normal  0.45981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1014  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  51.61 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2292  nucleoid protein Hbs  58.43 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  51.61 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  58.06 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1412  histone-like DNA-binding protein  59.09 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000277772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3065  nucleoid protein Hbs  59.55 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135138  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  56.99 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  53.26 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1789  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  56.99 
 
 		 96 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  55.06 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1633  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2026  histone family protein DNA-binding protein  54.84 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000760647  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2337  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000498066  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1743  histone family protein DNA-binding protein  54.84 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1187  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2621  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348082  normal  0.0833374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  51.06 
 
 		 94 aa  96.7  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2521  DNA-binding protein HU-beta  56.04 
 
 		 94 aa  95.9  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0944475  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3781  HU family DNA-binding protein  56.98 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0095051  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2793  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 94 aa  95.9  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3566  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.276347 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  52.81 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2386  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 94 aa  95.9  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  55.91 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  52.81 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  52.81 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0170  histone family protein DNA-binding protein  54.84 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000201093 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  55.06 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  52.81 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  52.81 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  52.81 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  52.81 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0188  histone family protein DNA-binding protein  54.84 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1873  HU family DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.972501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  48.94 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  51.69 
 
 		 92 aa  94.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  94.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1544  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000007734  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09623  probable DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.355669  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  94  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  94  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2678  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1918  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000897645  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3110  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  hitchhiker  0.00000299463 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2248  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.117837  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0712  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2505  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791734  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01420  nucleoid DNA-binding protein  54.65 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  47.78 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  51.16 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2593  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1929  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0431821 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2697  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2650  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  91.3  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>