More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36290 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36290  nucleoid DNA-binding protein  100 
 
 		 94 aa  180  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2507  histone family protein DNA-binding protein  86.96 
 
 		 93 aa  160  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.748528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3268  histone family protein DNA-binding protein  80.43 
 
 		 93 aa  147  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2752  histone family protein DNA-binding protein  82.42 
 
 		 93 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1976  nucleoid DNA-binding protein  66.3 
 
 		 93 aa  130  7.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0705  DNA-binding protein HU  66.3 
 
 		 93 aa  127  6e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3371  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 92 aa  114  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.557134  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26150  nucleoid DNA-binding protein  56.82 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1900  histone family protein DNA-binding protein  64.13 
 
 		 93 aa  100  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.785636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19160  nucleoid DNA-binding protein  54.35 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34702  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3718  histone family protein DNA-binding protein  53.19 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3916  histone family protein DNA-binding protein  53.19 
 
 		 94 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0298  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406887  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4472  histone family protein DNA-binding protein  52.17 
 
 		 93 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00595179 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2207  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  84  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2799  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3398  histone family protein DNA-binding protein  48.91 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000223697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  44.57 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  44.57 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  47.73 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  45.98 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2054  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333504  normal  0.0104655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2824  nucleoid protein Hbs  44.44 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.669113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  42.39 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  45.56 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  45.98 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_011883  Ddes_0087  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0121  DNA-binding protein HU  44.71 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022412 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  42.39 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  43.33 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  42.39 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  42.39 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  42.39 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  42.39 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  42.39 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  42.39 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  42.22 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  41.3 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  41.3 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  47.73 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  41.3 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  41.3 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  41.3 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  41.3 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  41.3 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  41.38 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3158  histone-like DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1918  histone family protein DNA-binding protein  38.89 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000897645  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  39.56 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  46.67 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  47.95 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 95 aa  73.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0183  DNA-binding protein HU 1  44.94 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000296943  hitchhiker  2.26878e-36 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1538  DNA-binding protein HU  47.25 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000676058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1546  histone family protein DNA-binding protein  43.48 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.0402e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0956  histone family protein DNA-binding protein  40.22 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  44.19 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0983  histone family protein DNA-binding protein  40.22 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0475372 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  40.45 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10570  histone family protein DNA-binding protein  41.24 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>