More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3268 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3268  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 93 aa  179  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36290  nucleoid DNA-binding protein  80.43 
 
 		 94 aa  147  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2507  histone family protein DNA-binding protein  76.34 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.748528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2752  histone family protein DNA-binding protein  76.92 
 
 		 93 aa  144  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1976  nucleoid DNA-binding protein  70.97 
 
 		 93 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0705  DNA-binding protein HU  70.65 
 
 		 93 aa  133  8e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3371  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 92 aa  110  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.557134  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26150  nucleoid DNA-binding protein  55.68 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19160  nucleoid DNA-binding protein  55.91 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34702  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0298  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 94 aa  99.4  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406887  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3916  histone family protein DNA-binding protein  51.61 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3718  histone family protein DNA-binding protein  52.17 
 
 		 95 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  90.1  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4472  histone family protein DNA-binding protein  48.39 
 
 		 93 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00595179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1900  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.785636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2207  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  47.25 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 92 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  47.25 
 
 		 92 aa  85.5  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 92 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  47.25 
 
 		 92 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2799  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 91 aa  84.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 92 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 92 aa  85.5  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 92 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  53.41 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  46.15 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  46.15 
 
 		 92 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  46.15 
 
 		 92 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  46.15 
 
 		 92 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  46.15 
 
 		 92 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  46.15 
 
 		 92 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  46.15 
 
 		 92 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2521  DNA-binding protein HU-beta  52.81 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0944475  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1743  histone family protein DNA-binding protein  45.16 
 
 		 106 aa  83.6  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2386  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2793  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2026  histone family protein DNA-binding protein  44.09 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000760647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  50 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3398  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000223697  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0548  HU family DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  51.16 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  50 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0087  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  56.16 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0964  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000994236  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4039  HU family DNA-binding protein  56.04 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4749  histone-like DNA-binding protein  56.04 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  51.65 
 
 		 92 aa  80.1  0.000000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_008577  Shewana3_0547  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3943  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3325  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0507  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0267079  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3817  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3761  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.768478 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0548  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5039  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  45.05 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3555  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3158  histone-like DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  45.05 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3482  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3231  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 91 aa  76.6  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  47.78 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  48.35 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  48.35 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>