More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3718 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3718  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 95 aa  188  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3916  histone family protein DNA-binding protein  97.87 
 
 		 94 aa  182  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4472  histone family protein DNA-binding protein  79.35 
 
 		 93 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00595179 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19160  nucleoid DNA-binding protein  71.74 
 
 		 93 aa  132  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34702  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3371  histone family protein DNA-binding protein  58.62 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.557134  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36290  nucleoid DNA-binding protein  53.19 
 
 		 94 aa  98.6  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2752  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 93 aa  97.8  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2507  histone family protein DNA-binding protein  51.61 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.748528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3268  histone family protein DNA-binding protein  52.17 
 
 		 93 aa  92.8  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0298  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 94 aa  90.9  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406887  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26150  nucleoid DNA-binding protein  47.13 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0705  DNA-binding protein HU  43.48 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1976  nucleoid DNA-binding protein  43.48 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  46.15 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1900  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.785636  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  43.96 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  43.96 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  43.96 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  43.96 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  43.96 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  43.96 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  43.96 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  42.7 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1251  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0902596  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2903  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00933352  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  47.73 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  46.59 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  43.18 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  43.18 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  43.18 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  43.18 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  43.18 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  43.18 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  43.18 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  43.18 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  43.18 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2521  DNA-binding protein HU-beta  47.25 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0944475  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  42.05 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  45.45 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  45.45 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  45.45 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  45.45 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  45.45 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  42.05 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  42.05 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2386  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  45.45 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2793  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  45.45 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  42.05 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  45.45 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1118  HU family DNA-binding protein  43.33 
 
 		 91 aa  72  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  45.45 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09623  probable DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.355669  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  41.3 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  41.3 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2207  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4973  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00898585  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  39.33 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  41.3 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  42.35 
 
 		 90 aa  70.1  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4958  histone-like DNA-binding protein  40.45 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  46.24 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4704  histone-like DNA-binding protein  40.22 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4682  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0505442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1412  histone-like DNA-binding protein  44.94 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000277772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0956  DNA-binding protein HU-alpha  42.7 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  40.45 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  44.32 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1584  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.532726  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2054  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333504  normal  0.0104655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2824  nucleoid protein Hbs  42.7 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.669113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  41.57 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3723  DNA-binding protein HU-beta  41.57 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  41.76 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1035  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00000557803  hitchhiker  0.00000000462139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1750  histone-like DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.519537  normal  0.0235988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0628  histone-like DNA-binding protein  38.04 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3694  nucleoid protein HU beta subunit  41.57 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.566059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0914  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.196839  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  41.57 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>