More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4958 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_4958  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 103 aa  198  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  91.21 
 
 		 103 aa  167  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0007  histone-like DNA-binding protein  67.06 
 
 		 98 aa  118  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  60.87 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  60.87 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  60.87 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  60.87 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  60.87 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  60.87 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  60.87 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  60.87 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  60.87 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  60.87 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  60.87 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  60.87 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  60.87 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  60.87 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  58.7 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  59.78 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  58.7 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2337  histone-like DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000498066  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  59.3 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3512  histone-like DNA-binding protein  57.3 
 
 		 99 aa  102  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.848806  normal  0.0177296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0712  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  53.33 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  53.33 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  53.33 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  55.81 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  52.22 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  55.56 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  54.44 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2793  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2521  DNA-binding protein HU-beta  56.67 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0944475  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 94 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2386  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 94 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4236  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2303  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0561689  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3466  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360259  hitchhiker  0.000212777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  51.11 
 
 		 90 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002182  DNA-binding protein HU-alpha  53.33 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131368  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7326  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 92 aa  97.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  51.11 
 
 		 90 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  51.11 
 
 		 90 aa  97.8  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4039  HU family DNA-binding protein  59.78 
 
 		 93 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4749  histone-like DNA-binding protein  59.78 
 
 		 93 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1905  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173408  hitchhiker  0.000216257 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  53.49 
 
 		 98 aa  97.4  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  51.11 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2621  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348082  normal  0.0833374 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  51.11 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  51.11 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1187  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  51.11 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  51.11 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  51.11 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  51.11 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1956  nucleoid protein Hbs  53.33 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.582961  normal  0.45981 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  52.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  51.11 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3158  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1014  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  51.11 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2292  nucleoid protein Hbs  53.33 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1633  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2650  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0213  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.81 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00855152  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  47.78 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0290  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.81 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0031706  hitchhiker  0.00995537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2697  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0222  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.81 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4682  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0505442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3566  histone family protein DNA-binding protein  53.68 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.276347 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0226  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.81 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0975648  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0956  DNA-binding protein HU-alpha  52.22 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  51.11 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  50 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  50 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  50 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>