More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4973 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4973  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 167 aa  320  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00898585  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1234  histone family protein DNA-binding protein  52.08 
 
 		 159 aa  97.4  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.253249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  48.84 
 
 		 90 aa  89  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  48.39 
 
 		 95 aa  88.6  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 94 aa  87.4  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10750  nucleoid DNA-binding protein  45.83 
 
 		 106 aa  87.4  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0258  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 91 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  46.24 
 
 		 94 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 232 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  84.7  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  84.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  84.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  46.67 
 
 		 91 aa  84.7  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  85.1  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  46.67 
 
 		 91 aa  84  8e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 91 aa  84  9e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  47.78 
 
 		 91 aa  84  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  43.82 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  47.78 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0983  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0475372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0956  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  45.12 
 
 		 91 aa  80.5  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  40.45 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0183  DNA-binding protein HU 1  44.94 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000296943  hitchhiker  2.26878e-36 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0579  histone-like DNA-binding protein  44.94 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410031  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2092  nucleoid protein Hbs  44.94 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05711  histone-like DNA-binding protein  44.94 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1918  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000897645  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  40.7 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  39.33 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  44.94 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  43.02 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13741  histone-like DNA-binding protein  43.82 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17471  histone-like DNA-binding protein  44.94 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0892  histone-like DNA-binding protein  44.94 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.879625  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  39.56 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  43.02 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 94 aa  77  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  43.02 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  43.02 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  43.02 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  43.02 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  43.02 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  43.02 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0187  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 93 aa  77  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 91 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  43.02 
 
 		 90 aa  77  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  43.02 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 92 aa  77  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  43.02 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  40.45 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  40.45 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10570  histone family protein DNA-binding protein  44.21 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  40.45 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  39.53 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  40.45 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  40.45 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  40.45 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  40.45 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  41.86 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  40.45 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  40.45 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1251  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0902596  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2903  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00933352  normal  0.626047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>