More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8047 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 232 aa  391  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4997  histone family protein DNA-binding protein  53.03 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0187  histone family protein DNA-binding protein  62.77 
 
 		 93 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8015  histone-like DNA-binding protein  60 
 
 		 99 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  58.06 
 
 		 92 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2846  histone family protein DNA-binding protein  52.53 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1260  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00209562  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2800  histone family protein DNA-binding protein  56.84 
 
 		 98 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224088  normal  0.168856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6004  histone family protein DNA-binding protein  61.46 
 
 		 285 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0576704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1151  histone family protein DNA-binding protein  61.8 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1589  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 163 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 94 aa  101  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3213  histone family protein DNA-binding protein  52.13 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2337  histone family protein DNA-binding protein  48.08 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  55.81 
 
 		 94 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1234  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 159 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.253249  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1360  histone family protein DNA-binding protein  48.57 
 
 		 179 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659546  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2137  histone family protein DNA-binding protein  47.79 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0628  histone-like DNA-binding protein  55.32 
 
 		 93 aa  96.7  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2005  histone family protein DNA-binding protein  47.12 
 
 		 188 aa  96.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 91 aa  96.3  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  52.22 
 
 		 90 aa  95.5  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3296  nucleoid protein Hbs  50 
 
 		 202 aa  95.5  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  94.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2805  histone family protein DNA-binding protein  45.9 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.535515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  93.2  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4973  histone family protein DNA-binding protein  46.51 
 
 		 167 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00898585  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  92.8  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  92.8  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  92.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  92.4  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6397  DNA-binding protein Hu-beta  50 
 
 		 144 aa  92.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  92  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  92  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  92  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  92  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  92  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  92  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  92  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  92  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  92  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  92  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  51.11 
 
 		 92 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  92  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4225  histone family protein DNA-binding protein  51.55 
 
 		 217 aa  92  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  92  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 92 aa  92  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 92 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  51.69 
 
 		 91 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  50 
 
 		 126 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  51.69 
 
 		 90 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  50 
 
 		 92 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  50 
 
 		 92 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  50 
 
 		 92 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  44.44 
 
 		 90 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  50 
 
 		 92 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  50 
 
 		 92 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  89.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  50 
 
 		 92 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 92 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 92 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 92 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  89.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 92 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 92 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 92 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 92 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1923  nucleoid protein Hbs  51.06 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 95 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1969  nucleoid protein Hbs  51.06 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.843128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1903  nucleoid protein Hbs  51.06 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.388212 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0183  DNA-binding protein HU 1  50.56 
 
 		 90 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000296943  hitchhiker  2.26878e-36 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  50.55 
 
 		 91 aa  89  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 		 91 aa  88.6  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  88.6  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  88.6  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  88.2  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  48.86 
 
 		 90 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0579  histone-like DNA-binding protein  50.55 
 
 		 91 aa  87.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410031  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2092  nucleoid protein Hbs  50.55 
 
 		 91 aa  87.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05711  histone-like DNA-binding protein  50.55 
 
 		 91 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3359  histone-like DNA-binding protein HU-beta (NS1)  50.54 
 
 		 92 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  49.45 
 
 		 91 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01420  nucleoid DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 91 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004041  DNA-binding protein HU-beta  44.44 
 
 		 90 aa  86.7  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17471  histone-like DNA-binding protein  50.55 
 
 		 91 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>