More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1360 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1360  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 179 aa  332  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659546  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2805  histone family protein DNA-binding protein  87.16 
 
 		 187 aa  197  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.535515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2337  histone family protein DNA-binding protein  90.2 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2005  histone family protein DNA-binding protein  90.2 
 
 		 188 aa  194  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1151  histone family protein DNA-binding protein  63.04 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4997  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1260  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00209562  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0628  histone-like DNA-binding protein  56.52 
 
 		 93 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  57.61 
 
 		 92 aa  108  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1589  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 163 aa  108  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6004  histone family protein DNA-binding protein  57.45 
 
 		 285 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0576704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0187  histone family protein DNA-binding protein  53.26 
 
 		 93 aa  100  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2800  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 98 aa  100  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224088  normal  0.168856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1903  nucleoid protein Hbs  58.95 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.388212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1923  nucleoid protein Hbs  58.95 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1969  nucleoid protein Hbs  58.95 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.843128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13001  DNA-binding protein hupB (histone-like protein)  57.89 
 
 		 214 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2846  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 235 aa  99.8  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8015  histone-like DNA-binding protein  52.81 
 
 		 99 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1480  histone family protein DNA-binding protein  57.89 
 
 		 222 aa  99  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.041939  normal  0.737338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3296  nucleoid protein Hbs  54.74 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2137  histone family protein DNA-binding protein  56.84 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3213  histone family protein DNA-binding protein  52.63 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4225  histone family protein DNA-binding protein  56.84 
 
 		 217 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  53.33 
 
 		 94 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 94 aa  94.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 232 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10750  nucleoid DNA-binding protein  46.81 
 
 		 106 aa  87  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0258  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  47.73 
 
 		 90 aa  85.5  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  47.78 
 
 		 103 aa  85.1  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4958  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 103 aa  84.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  51.16 
 
 		 91 aa  83.6  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  46.15 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  48.94 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4236  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1234  histone family protein DNA-binding protein  45 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.253249  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  48.39 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1918  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 92 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000225021  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  48.86 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2292  nucleoid protein Hbs  46.67 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1014  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  45.98 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3065  nucleoid protein Hbs  44.44 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135138  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1633  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1789  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  47.78 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  44.44 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  44.44 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  44.44 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  44.44 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  44.44 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  44.44 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3445  hypothetical protein  44.09 
 
 		 106 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106732  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 92 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  77  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 94 aa  77  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 92 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 92 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  44.44 
 
 		 126 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  46.15 
 
 		 90 aa  77  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 92 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 92 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  47.73 
 
 		 91 aa  77  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  46.59 
 
 		 91 aa  77  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 92 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 92 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0007  histone-like DNA-binding protein  47.67 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1956  nucleoid protein Hbs  43.33 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.582961  normal  0.45981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1187  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0015  Histone-like DNA-binding protein  46.74 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2621  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348082  normal  0.0833374 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  43.33 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>