More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2846 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2846  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 235 aa  403  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2137  histone family protein DNA-binding protein  83.93 
 
 		 212 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4225  histone family protein DNA-binding protein  85.71 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3213  histone family protein DNA-binding protein  76.64 
 
 		 193 aa  168  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4997  histone family protein DNA-binding protein  50.99 
 
 		 185 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6004  histone family protein DNA-binding protein  71.88 
 
 		 285 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0576704  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1589  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 163 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1480  histone family protein DNA-binding protein  61.46 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.041939  normal  0.737338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1151  histone family protein DNA-binding protein  59.38 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1260  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00209562  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0187  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 		 93 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1360  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 179 aa  101  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659546  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2337  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 185 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2805  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 187 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.535515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0628  histone-like DNA-binding protein  53.19 
 
 		 93 aa  99.8  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2005  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 188 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3296  nucleoid protein Hbs  51.04 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 92 aa  95.9  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 94 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2800  histone family protein DNA-binding protein  48.94 
 
 		 98 aa  93.2  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224088  normal  0.168856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 94 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8015  histone-like DNA-binding protein  47.78 
 
 		 99 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13001  DNA-binding protein hupB (histone-like protein)  55.34 
 
 		 214 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 103 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4958  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 103 aa  85.5  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10750  nucleoid DNA-binding protein  44.76 
 
 		 106 aa  85.5  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0258  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  85.1  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  43.02 
 
 		 90 aa  85.1  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  44.19 
 
 		 90 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  48.78 
 
 		 90 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  41.86 
 
 		 90 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  46.59 
 
 		 90 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  43.82 
 
 		 95 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  45.12 
 
 		 90 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  46.34 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  46.34 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  46.34 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  46.34 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  46.34 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  46.34 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  46.34 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  46.34 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1234  histone family protein DNA-binding protein  48.39 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.253249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  46.34 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  46.34 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  46.34 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  40.7 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  45.35 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  44.44 
 
 		 91 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  46.34 
 
 		 90 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0007  histone-like DNA-binding protein  47.06 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  43.9 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  41.46 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  41.86 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  43.9 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  41.46 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2937  histone family protein DNA-binding protein  46.51 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3159  histone family protein DNA-binding protein  46.51 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.124819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  43.9 
 
 		 94 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  41.46 
 
 		 90 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01420  nucleoid DNA-binding protein  39.02 
 
 		 90 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  42.42 
 
 		 95 aa  78.2  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2493  integration host factor subunit alpha  41.38 
 
 		 98 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004041  DNA-binding protein HU-beta  40.24 
 
 		 90 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  45.12 
 
 		 90 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3512  histone-like DNA-binding protein  45.98 
 
 		 99 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.848806  normal  0.0177296 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 91 aa  77.4  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0975  histone family protein DNA-binding protein  46.59 
 
 		 88 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  45.12 
 
 		 90 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1918  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 92 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000225021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  44.19 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  41.46 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  37.78 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0600  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0791658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  40.7 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  40.7 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  40.7 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  40.7 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  40.7 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  40.7 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  40.7 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>