More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1589 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1589  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 163 aa  291  3e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462794 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0187  histone family protein DNA-binding protein  65.56 
 
 		 93 aa  120  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3296  nucleoid protein Hbs  64.29 
 
 		 202 aa  120  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4997  histone family protein DNA-binding protein  49.3 
 
 		 185 aa  120  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6004  histone family protein DNA-binding protein  64.95 
 
 		 285 aa  117  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0576704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2846  histone family protein DNA-binding protein  60.82 
 
 		 235 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0628  histone-like DNA-binding protein  60 
 
 		 93 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3213  histone family protein DNA-binding protein  58.25 
 
 		 193 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2337  histone family protein DNA-binding protein  56.73 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1360  histone family protein DNA-binding protein  57.58 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659546  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8015  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 99 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2800  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 98 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224088  normal  0.168856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2137  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 212 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4225  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1923  nucleoid protein Hbs  60.19 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2005  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 188 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1903  nucleoid protein Hbs  60.19 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.388212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2805  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 187 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.535515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1969  nucleoid protein Hbs  60.19 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.843128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1151  histone family protein DNA-binding protein  58.95 
 
 		 209 aa  104  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1260  histone family protein DNA-binding protein  61.36 
 
 		 237 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00209562  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13001  DNA-binding protein hupB (histone-like protein)  58.1 
 
 		 214 aa  104  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1480  histone family protein DNA-binding protein  55.88 
 
 		 222 aa  101  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.041939  normal  0.737338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  56.67 
 
 		 94 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 94 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1234  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.253249  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10750  nucleoid DNA-binding protein  44.21 
 
 		 106 aa  84.7  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0258  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  84.3  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 91 aa  84  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 91 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  51.16 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6397  DNA-binding protein Hu-beta  42.02 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4973  histone family protein DNA-binding protein  42.59 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00898585  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  50 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  48.86 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0579  histone-like DNA-binding protein  49.45 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410031  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2092  nucleoid protein Hbs  49.45 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  47.78 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  48.84 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2248  nucleoid protein Hbs  46.15 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0990789 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05711  histone-like DNA-binding protein  47.25 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7326  histone family protein DNA-binding protein  46.74 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  48.31 
 
 		 90 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  46.15 
 
 		 90 aa  77  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  45.56 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4958  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17471  histone-like DNA-binding protein  48.35 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>