More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1480 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1480  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 222 aa  398  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.041939  normal  0.737338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4997  histone family protein DNA-binding protein  53.73 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3213  histone family protein DNA-binding protein  64.21 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2846  histone family protein DNA-binding protein  61.46 
 
 		 235 aa  122  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6004  histone family protein DNA-binding protein  71.13 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0576704  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2805  histone family protein DNA-binding protein  59.78 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.535515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2005  histone family protein DNA-binding protein  59.78 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1260  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00209562  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2137  histone family protein DNA-binding protein  62.5 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1151  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1360  histone family protein DNA-binding protein  58.7 
 
 		 179 aa  111  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659546  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4225  histone family protein DNA-binding protein  62.5 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13001  DNA-binding protein hupB (histone-like protein)  60.42 
 
 		 214 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1589  histone family protein DNA-binding protein  57.89 
 
 		 163 aa  106  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462794 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3296  nucleoid protein Hbs  52.58 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1903  nucleoid protein Hbs  58.95 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.388212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1923  nucleoid protein Hbs  58.95 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1969  nucleoid protein Hbs  58.95 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.843128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0628  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 93 aa  92.8  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2337  histone family protein DNA-binding protein  42.61 
 
 		 185 aa  92.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  51.16 
 
 		 94 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  51.16 
 
 		 94 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  47.73 
 
 		 90 aa  91.7  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0187  histone family protein DNA-binding protein  54.26 
 
 		 93 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 92 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8015  histone-like DNA-binding protein  50.56 
 
 		 99 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3065  nucleoid protein Hbs  49.44 
 
 		 90 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135138  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1633  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1789  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  86.3  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2800  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 98 aa  86.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224088  normal  0.168856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  85.5  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  85.1  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  85.1  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  85.1  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  44.83 
 
 		 90 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  51.16 
 
 		 91 aa  84.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2621  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348082  normal  0.0833374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1187  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1956  nucleoid protein Hbs  47.19 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.582961  normal  0.45981 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2292  nucleoid protein Hbs  47.19 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1014  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4236  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  47.73 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004041  DNA-binding protein HU-beta  45.98 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  44.83 
 
 		 90 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  44.83 
 
 		 96 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  47.13 
 
 		 92 aa  81.3  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  45.56 
 
 		 91 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01420  nucleoid DNA-binding protein  44.83 
 
 		 90 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2697  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 105 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  46.51 
 
 		 90 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  43.18 
 
 		 91 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  44.83 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  44.83 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  44.83 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  44.83 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  44.83 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  44.83 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  44.83 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  44.83 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13741  histone-like DNA-binding protein  47.13 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  44.83 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1234  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.253249  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05711  histone-like DNA-binding protein  46.15 
 
 		 91 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2650  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17471  histone-like DNA-binding protein  46.15 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0892  histone-like DNA-binding protein  46.15 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.879625  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0579  histone-like DNA-binding protein  46.15 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410031  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2092  nucleoid protein Hbs  46.15 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1509  DNA-binding protein HU-beta  44.83 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000490467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  43.68 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>