More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1969 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1969  nucleoid protein Hbs  100 
 
 		 225 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.843128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1903  nucleoid protein Hbs  100 
 
 		 225 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.388212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1923  nucleoid protein Hbs  100 
 
 		 225 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13001  DNA-binding protein hupB (histone-like protein)  90.65 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2137  histone family protein DNA-binding protein  90.74 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4225  histone family protein DNA-binding protein  91.51 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2846  histone family protein DNA-binding protein  82.69 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3213  histone family protein DNA-binding protein  79.63 
 
 		 193 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4997  histone family protein DNA-binding protein  50.92 
 
 		 185 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6004  histone family protein DNA-binding protein  66.32 
 
 		 285 aa  118  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0576704  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1589  histone family protein DNA-binding protein  61.05 
 
 		 163 aa  116  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2337  histone family protein DNA-binding protein  56.84 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1360  histone family protein DNA-binding protein  58.95 
 
 		 179 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659546  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2805  histone family protein DNA-binding protein  56.84 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.535515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2005  histone family protein DNA-binding protein  56.84 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0628  histone-like DNA-binding protein  57.45 
 
 		 93 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1151  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0187  histone family protein DNA-binding protein  57.45 
 
 		 93 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1260  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 237 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00209562  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3296  nucleoid protein Hbs  54.74 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1480  histone family protein DNA-binding protein  58.95 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.041939  normal  0.737338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 92 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2800  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 98 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224088  normal  0.168856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8015  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 99 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 94 aa  95.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  53.33 
 
 		 94 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  51.22 
 
 		 90 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  47.56 
 
 		 90 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  47.56 
 
 		 90 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  47.56 
 
 		 90 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  47.56 
 
 		 90 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  47.56 
 
 		 90 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  47.56 
 
 		 90 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  47.56 
 
 		 90 aa  87  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  47.56 
 
 		 90 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  47.56 
 
 		 90 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  47.56 
 
 		 90 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  47.56 
 
 		 90 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  48.78 
 
 		 90 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4958  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 103 aa  85.9  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  45.12 
 
 		 90 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  47.56 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  46.67 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  43.33 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  43.82 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  45.35 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  40.7 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  47.67 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 91 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  44.32 
 
 		 90 aa  80.9  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  47.67 
 
 		 90 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1234  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 159 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.253249  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  81.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  43.02 
 
 		 90 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  43.02 
 
 		 90 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  44.68 
 
 		 96 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  43.9 
 
 		 94 aa  80.5  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  44.44 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  39.53 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  44.44 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  44.44 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  44.44 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  44.44 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  44.44 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2937  histone family protein DNA-binding protein  46.51 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  43.02 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3159  histone family protein DNA-binding protein  46.51 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.124819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0975  histone family protein DNA-binding protein  48.86 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  43.9 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  41.76 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  43.33 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  46.91 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0532  histone-like protein  43.02 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10750  nucleoid DNA-binding protein  42.31 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0258  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 92 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0007  histone-like DNA-binding protein  44.71 
 
 		 98 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 92 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  43.33 
 
 		 92 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 92 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  43.33 
 
 		 92 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0015  Histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 97 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 92 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  44.32 
 
 		 91 aa  77.8  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 92 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  41.86 
 
 		 91 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>