More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4997 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4997  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 185 aa  358  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1151  histone family protein DNA-binding protein  72.73 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1260  histone family protein DNA-binding protein  71.59 
 
 		 237 aa  130  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00209562  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2846  histone family protein DNA-binding protein  59.38 
 
 		 235 aa  117  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3213  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1360  histone family protein DNA-binding protein  58.51 
 
 		 179 aa  114  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659546  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2337  histone family protein DNA-binding protein  57.45 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6004  histone family protein DNA-binding protein  62.5 
 
 		 285 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0576704  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2805  histone family protein DNA-binding protein  56.38 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.535515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1589  histone family protein DNA-binding protein  57.45 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2005  histone family protein DNA-binding protein  56.38 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0628  histone-like DNA-binding protein  58.06 
 
 		 93 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0187  histone family protein DNA-binding protein  54.84 
 
 		 93 aa  108  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2137  histone family protein DNA-binding protein  57.52 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  56.52 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3296  nucleoid protein Hbs  54.64 
 
 		 202 aa  104  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4225  histone family protein DNA-binding protein  61.46 
 
 		 217 aa  104  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1480  histone family protein DNA-binding protein  59 
 
 		 222 aa  104  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.041939  normal  0.737338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8015  histone-like DNA-binding protein  51.61 
 
 		 99 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13001  DNA-binding protein hupB (histone-like protein)  58.33 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2800  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 98 aa  100  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224088  normal  0.168856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1903  nucleoid protein Hbs  58.95 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.388212 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1969  nucleoid protein Hbs  58.95 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.843128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1923  nucleoid protein Hbs  58.95 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 94 aa  97.8  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 94 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  52.17 
 
 		 232 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  85.9  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 91 aa  84.3  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  84  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  46.59 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  47.73 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 91 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  47.83 
 
 		 92 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 91 aa  80.9  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4958  histone-like DNA-binding protein  47.19 
 
 		 103 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  47.19 
 
 		 95 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  80.5  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1234  histone family protein DNA-binding protein  47.83 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.253249  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  44.32 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  47.67 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  45.05 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2337  histone-like DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000498066  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0007  histone-like DNA-binding protein  45.88 
 
 		 98 aa  77.4  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  42.53 
 
 		 90 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  40.23 
 
 		 90 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  42.53 
 
 		 90 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_007972  Rmet_6397  DNA-binding protein Hu-beta  47.83 
 
 		 144 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  42.55 
 
 		 94 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  43.68 
 
 		 90 aa  77  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  48.31 
 
 		 94 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  42.55 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  42.7 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  42.7 
 
 		 103 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  40.23 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10750  nucleoid DNA-binding protein  38.54 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0258  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  50 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  43.18 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2303  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0561689  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  41.11 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3466  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360259  hitchhiker  0.000212777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  41.38 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  38.61 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2802  DNA-binding protein HU  42.22 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000141643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2488  DNA-binding protein HU  42.22 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000405619  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3065  nucleoid protein Hbs  42.53 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135138  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1905  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173408  hitchhiker  0.000216257 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  41.49 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  44.44 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  45.05 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  42.53 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  43.82 
 
 		 92 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  43.82 
 
 		 92 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>