More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8015 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8015  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 99 aa  196  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2800  histone family protein DNA-binding protein  83.67 
 
 		 98 aa  166  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224088  normal  0.168856 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0628  histone-like DNA-binding protein  70.21 
 
 		 93 aa  133  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0187  histone family protein DNA-binding protein  71.91 
 
 		 93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  65.91 
 
 		 92 aa  120  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  61.11 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1151  histone family protein DNA-binding protein  59.09 
 
 		 209 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1589  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 163 aa  106  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 232 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1260  histone family protein DNA-binding protein  56.82 
 
 		 237 aa  103  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00209562  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4997  histone family protein DNA-binding protein  51.61 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2005  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 188 aa  101  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2805  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 187 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.535515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2337  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 185 aa  100  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1360  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 179 aa  99.4  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659546  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3445  hypothetical protein  48.89 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106732  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2846  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 235 aa  90.9  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4682  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0505442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0956  DNA-binding protein HU-alpha  48.89 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3213  histone family protein DNA-binding protein  48.45 
 
 		 193 aa  89.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  87.8  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3296  nucleoid protein Hbs  50 
 
 		 202 aa  87  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  87  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  50.56 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  44.44 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1969  nucleoid protein Hbs  52.22 
 
 		 225 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.843128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1923  nucleoid protein Hbs  52.22 
 
 		 225 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1903  nucleoid protein Hbs  52.22 
 
 		 225 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.388212 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6004  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 285 aa  84.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0576704  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0170  histone family protein DNA-binding protein  47 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000201093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0188  histone family protein DNA-binding protein  47 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  46.59 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  49.44 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  50 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13001  DNA-binding protein hupB (histone-like protein)  50 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4236  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2137  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 212 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  47.73 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4225  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 217 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0548  HU family DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1234  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.253249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  42.86 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  45.56 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  45.56 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  45.56 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  45.56 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  45.05 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  45.56 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  45.56 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  43.82 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10750  nucleoid DNA-binding protein  39.77 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0258  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>