More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10750 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_10750  nucleoid DNA-binding protein  100 
 
 		 106 aa  207  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0258  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  50.54 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1360  histone family protein DNA-binding protein  46.81 
 
 		 179 aa  87.8  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659546  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3213  histone family protein DNA-binding protein  42.06 
 
 		 193 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2337  histone family protein DNA-binding protein  44.68 
 
 		 185 aa  86.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2005  histone family protein DNA-binding protein  43.62 
 
 		 188 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2846  histone family protein DNA-binding protein  44.76 
 
 		 235 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4973  histone family protein DNA-binding protein  45.83 
 
 		 167 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00898585  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2805  histone family protein DNA-binding protein  43.62 
 
 		 187 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.535515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1589  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4236  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8015  histone-like DNA-binding protein  39.77 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0628  histone-like DNA-binding protein  37.78 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4997  histone family protein DNA-binding protein  38.54 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0187  histone family protein DNA-binding protein  39.77 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2137  histone family protein DNA-binding protein  43.27 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4225  histone family protein DNA-binding protein  43.27 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  41.05 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13001  DNA-binding protein hupB (histone-like protein)  42.99 
 
 		 214 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  45 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  40.45 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1234  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.253249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1260  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 237 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00209562  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6004  histone family protein DNA-binding protein  43.16 
 
 		 285 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0576704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1151  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 209 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1969  nucleoid protein Hbs  42.31 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.843128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3512  histone-like DNA-binding protein  37.08 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.848806  normal  0.0177296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1903  nucleoid protein Hbs  42.31 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.388212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2800  histone family protein DNA-binding protein  37.5 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224088  normal  0.168856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1923  nucleoid protein Hbs  42.31 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  40.45 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0015  Histone-like DNA-binding protein  39.39 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  37.08 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 90 aa  67  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 91 aa  67  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  39.33 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1480  histone family protein DNA-binding protein  43.3 
 
 		 222 aa  67  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.041939  normal  0.737338 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4958  histone-like DNA-binding protein  40.22 
 
 		 103 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1187  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2621  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348082  normal  0.0833374 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  38.89 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  40.22 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0087  histone family protein DNA-binding protein  42.68 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2126  histone family protein DNA-binding protein  46.34 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1274  histone family protein DNA-binding protein  46.34 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.630033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4704  histone-like DNA-binding protein  41.67 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2521  DNA-binding protein HU-beta  41.67 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0944475  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2386  histone family protein DNA-binding protein  41.67 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0007  histone-like DNA-binding protein  41.77 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  41.11 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2793  histone family protein DNA-binding protein  41.67 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  37.11 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1227  HU family DNA-binding protein  36.96 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000165625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  37.11 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1633  histone family protein DNA-binding protein  37.21 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2799  histone family protein DNA-binding protein  39.78 
 
 		 91 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  38.95 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  36.67 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1956  nucleoid protein Hbs  36.05 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.582961  normal  0.45981 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3398  histone family protein DNA-binding protein  43.04 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000223697  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2697  histone family protein DNA-binding protein  38.27 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  38.3 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  37.21 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  42.5 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  35.87 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  40.74 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  42.5 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  42.5 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  42.5 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  42.5 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  42.5 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  42.5 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  42.17 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  42.5 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  42.5 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3065  nucleoid protein Hbs  37.21 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135138  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  42.5 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  39.33 
 
 		 90 aa  62  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  41.25 
 
 		 90 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>