More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1274 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1274  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 90 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.630033  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2126  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 90 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  49.37 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  46.34 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  47.62 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  44.3 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
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NC_008789  Hhal_0600  histone family protein DNA-binding protein  48.19 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0791658  n/a   
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  43.37 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
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NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  43.02 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  44.58 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  44.58 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  46.84 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0975  histone family protein DNA-binding protein  45.12 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  47.5 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2386  histone family protein DNA-binding protein  46.91 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  44.58 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2521  DNA-binding protein HU-beta  46.91 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0944475  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  44.58 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  44.58 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2793  histone family protein DNA-binding protein  46.91 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0579  histone-like DNA-binding protein  44.58 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410031  n/a   
 
 
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NC_007516  Syncc9605_2092  nucleoid protein Hbs  44.58 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  44.58 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  44.58 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  44.58 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  44.71 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  43.37 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0892  histone-like DNA-binding protein  44.58 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.879625  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  47.5 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17471  histone-like DNA-binding protein  44.58 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  46.25 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5600  nucleoid protein HU alpha subunit  42.17 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  43.37 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  43.37 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4958  histone-like DNA-binding protein  46.84 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  43.37 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  43.37 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  43.37 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_70600  HU family DNA-binding protein  42.17 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  43.37 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  43.37 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008751  Dvul_2207  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.483194 
 
 
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NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  42.17 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
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NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  44.58 
 
 		 98 aa  76.6  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_2799  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 91 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_48480  histone-like DNA-binding protein  42.17 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.707299  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_5472  DNA-binding protein HU family  41.67 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009976  P9211_13741  histone-like DNA-binding protein  43.37 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_5027  histone-like DNA-binding protein  42.17 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.705107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  43.37 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
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NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  40.96 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  42.17 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  42.17 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  42.17 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  42.17 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  42.17 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
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NC_014000  Ava_D0015  Histone-like DNA-binding protein  42.86 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  43.21 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  42.17 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  42.17 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  42.17 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  38.55 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  42.17 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  42.17 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
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NC_009091  P9301_15071  histone-like DNA-binding protein  47.95 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  42.17 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  42.17 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15201  histone-like DNA-binding protein  47.95 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.581406  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  42.17 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  42.17 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14821  histone-like DNA-binding protein  46.58 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002182  DNA-binding protein HU-alpha  38.55 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131368  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4039  HU family DNA-binding protein  50 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007577  PMT9312_1419  histone-like DNA-binding protein  46.58 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4749  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  43.24 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
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NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  44.59 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4401  nucleoid protein HU alpha subunit  40.96 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.177499 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  41.77 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  41.77 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008820  P9303_05711  histone-like DNA-binding protein  42.17 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
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NC_009656  PSPA7_6125  putative DNA-binding protein  40.96 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_2846  histone family protein DNA-binding protein  43.21 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_0160  histone family protein DNA-binding protein  42.17 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.982339  normal  0.332624 
 
 
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NC_010322  PputGB1_5361  histone family protein DNA-binding protein  42.17 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322215 
 
 
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NC_009379  Pnuc_2026  histone family protein DNA-binding protein  39.29 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000760647  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  41.89 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
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NC_010531  Pnec_1743  histone family protein DNA-binding protein  38.1 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  41.86 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_1013  integration host factor subunit alpha  40.23 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00925023 
 
 
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NC_009511  Swit_2320  histone family protein DNA-binding protein  40.96 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313993 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  40.7 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  40.7 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011831  Cagg_2800  histone family protein DNA-binding protein  41.46 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.314241 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  37.35 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3758  histone family protein DNA-binding protein  41.77 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.639339  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  41.77 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  41.77 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  41.77 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
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