More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1767 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  100 
 
 
94 aa  185  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  94.62 
 
 
94 aa  177  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  89.13 
 
 
95 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  82.42 
 
 
91 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  76.67 
 
 
91 aa  147  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  81.11 
 
 
95 aa  146  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3159  histone family protein DNA-binding protein  80 
 
 
95 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.124819  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2937  histone family protein DNA-binding protein  80 
 
 
95 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0015  Histone-like DNA-binding protein  67.42 
 
 
97 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  61.8 
 
 
91 aa  114  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 
95 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15071  histone-like DNA-binding protein  57.3 
 
 
91 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15201  histone-like DNA-binding protein  57.3 
 
 
91 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.581406  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13741  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 
92 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0579  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410031  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2092  nucleoid protein Hbs  56.18 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0956  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 
98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0983  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 
98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0475372 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17471  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 
91 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0892  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 
91 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.879625  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1419  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 
91 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14821  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 
91 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 
91 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05711  histone-like DNA-binding protein  53.93 
 
 
91 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2248  nucleoid protein Hbs  52.81 
 
 
91 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0990789 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 
90 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 
91 aa  104  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 
90 aa  103  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 
90 aa  103  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  50.56 
 
 
90 aa  103  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 
90 aa  103  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 
91 aa  103  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 
95 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 
90 aa  101  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 
90 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 
90 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 
90 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 
90 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 
90 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 
92 aa  100  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3398  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 
92 aa  100  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000223697  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 
90 aa  100  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  53.93 
 
 
90 aa  100  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 
90 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  56.32 
 
 
98 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 
90 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  53.93 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  99.4  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 
90 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  54.44 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 
91 aa  98.6  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  56.63 
 
 
90 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2800  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 
91 aa  98.6  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.314241 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  52.81 
 
 
91 aa  98.2  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 
91 aa  97.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  52.81 
 
 
92 aa  97.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2802  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 
91 aa  97.1  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000141643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2488  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 
91 aa  97.1  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000405619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  51.69 
 
 
101 aa  96.7  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
90 aa  96.7  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  48.31 
 
 
91 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0964  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 
92 aa  96.3  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000994236  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002182  DNA-binding protein HU-alpha  50.56 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131368  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0090  histone-like DNA-binding protein  69.12 
 
 
80 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.791914  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0673  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
92 aa  94.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1538  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000676058  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  52.81 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  51.61 
 
 
94 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  51.61 
 
 
94 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4008  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 
92 aa  94  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735771  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  51.61 
 
 
96 aa  93.6  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>