More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2026 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2026  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 106 aa  209  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000760647  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1743  histone family protein DNA-binding protein  96.23 
 
 		 106 aa  200  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2793  histone family protein DNA-binding protein  67.03 
 
 		 94 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2521  DNA-binding protein HU-beta  67.03 
 
 		 94 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0944475  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2386  histone family protein DNA-binding protein  67.03 
 
 		 94 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  63.37 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  67.39 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  67.39 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  67.39 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  67.39 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  67.39 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  67.39 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  66.3 
 
 		 92 aa  120  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  66.3 
 
 		 92 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  66.3 
 
 		 92 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  66.3 
 
 		 92 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  66.3 
 
 		 92 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  66.3 
 
 		 92 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  66.3 
 
 		 92 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  65.22 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  66.3 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  65.22 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4039  HU family DNA-binding protein  69.89 
 
 		 93 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4749  histone-like DNA-binding protein  69.89 
 
 		 93 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3231  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 92 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3555  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 92 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3359  histone-like DNA-binding protein HU-beta (NS1)  58.24 
 
 		 92 aa  105  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2697  histone family protein DNA-binding protein  57.45 
 
 		 105 aa  104  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7326  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6397  DNA-binding protein Hu-beta  52.75 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2621  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348082  normal  0.0833374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2248  histone-like DNA-binding protein  57.89 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.117837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1187  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4682  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0505442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  60 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3392  HU family DNA-binding protein  55.43 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000680811  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0956  DNA-binding protein HU-alpha  55.56 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3538  HU family DNA-binding protein  56.52 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00490432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  60 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1633  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1789  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  58.89 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3065  nucleoid protein Hbs  58.89 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135138  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  56.67 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5472  DNA-binding protein HU family  50 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2673  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  99.4  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156087  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002182  DNA-binding protein HU-alpha  55.56 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131368  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  55.56 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  56.67 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  97.1  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  54.44 
 
 		 101 aa  97.1  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  53.33 
 
 		 91 aa  96.7  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  52.22 
 
 		 91 aa  96.7  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  49.46 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3512  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.848806  normal  0.0177296 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2337  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000498066  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  49.46 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1014  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  95.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5600  nucleoid protein HU alpha subunit  51.11 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2292  nucleoid protein Hbs  56.67 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  48.98 
 
 		 98 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4577  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.81 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511964 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4414  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.81 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.18011  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4501  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.81 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.358882  normal  0.0495174 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4381  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.81 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.842423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1956  nucleoid protein Hbs  56.67 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.582961  normal  0.45981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4503  transcriptional regulator HU subunit alpha  52.81 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0164141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>