More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1610 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  100 
 
 		 95 aa  188  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  84.44 
 
 		 91 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  82.22 
 
 		 94 aa  148  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  81.11 
 
 		 94 aa  146  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  76.67 
 
 		 95 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  70 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3159  histone family protein DNA-binding protein  69.57 
 
 		 95 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.124819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2937  histone family protein DNA-binding protein  69.57 
 
 		 95 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0015  Histone-like DNA-binding protein  62.79 
 
 		 97 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0983  histone family protein DNA-binding protein  57.61 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0475372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0956  histone family protein DNA-binding protein  57.61 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  53.68 
 
 		 95 aa  103  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2248  nucleoid protein Hbs  52.81 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0990789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15201  histone-like DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.581406  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15071  histone-like DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0579  histone-like DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410031  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2092  nucleoid protein Hbs  52.81 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05711  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14821  histone-like DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1419  histone-like DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13741  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0892  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.879625  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17471  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  50.57 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  52.81 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002182  DNA-binding protein HU-alpha  51.69 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131368  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  51.69 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3512  histone-like DNA-binding protein  53.93 
 
 		 99 aa  98.2  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.848806  normal  0.0177296 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  51.06 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  48.86 
 
 		 90 aa  97.8  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_28  DNA-binding protein HU-alpha  49.45 
 
 		 91 aa  97.8  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  49.43 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1538  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000676058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  52.17 
 
 		 94 aa  97.1  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 94 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  50.56 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  53.33 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  52.87 
 
 		 98 aa  96.7  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  50 
 
 		 91 aa  94.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3398  histone family protein DNA-binding protein  47.83 
 
 		 92 aa  94.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000223697  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004041  DNA-binding protein HU-beta  50.57 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2650  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  41.76 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 91 aa  93.6  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01420  nucleoid DNA-binding protein  49.43 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0007  histone-like DNA-binding protein  52.94 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0548  HU family DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  46.07 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  46.07 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>