More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0298 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0298  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 94 aa  184  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406887  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2507  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 93 aa  100  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.748528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3268  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 93 aa  99.4  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26150  nucleoid DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3371  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.557134  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36290  nucleoid DNA-binding protein  53.33 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2752  histone family protein DNA-binding protein  54.55 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19160  nucleoid DNA-binding protein  53.33 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34702  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1976  nucleoid DNA-binding protein  46.59 
 
 		 93 aa  91.7  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3718  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 95 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3916  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4472  histone family protein DNA-binding protein  47.73 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00595179 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0705  DNA-binding protein HU  44.32 
 
 		 93 aa  87.4  6e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  47.67 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  43.02 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  44.19 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4039  HU family DNA-binding protein  45.45 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  44.19 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4749  histone-like DNA-binding protein  45.45 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  41.86 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  41.86 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  39.36 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  45.45 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  40.7 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1743  histone family protein DNA-binding protein  40.7 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2026  histone family protein DNA-binding protein  41.86 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000760647  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  41.86 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  40.91 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  40.91 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  40.43 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  44.19 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  39.08 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  43.18 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3512  histone-like DNA-binding protein  40.7 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.848806  normal  0.0177296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  45.45 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  44.19 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  44.19 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  42.05 
 
 		 90 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  42.05 
 
 		 90 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  43.48 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  43.48 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  43.48 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  39.08 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  38.64 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70600  HU family DNA-binding protein  42.05 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  42.05 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  42.05 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  42.05 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  42.05 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  42.05 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  40.91 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  42.05 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1900  histone family protein DNA-binding protein  46.59 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.785636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  42.05 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  42.05 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  42.05 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  42.05 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  42.05 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1912  histone family protein DNA-binding protein  43.02 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  42.05 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  42.05 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  42.05 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  42.05 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  40.7 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  42.05 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  42.05 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  42.05 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  42.05 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  42.05 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  42.05 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  42.05 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  42.05 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5600  nucleoid protein HU alpha subunit  41.86 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1544  histone family protein DNA-binding protein  42.05 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000007734  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  42.05 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2678  histone family protein DNA-binding protein  42.05 
 
 		 90 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  43.18 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3110  histone family protein DNA-binding protein  42.05 
 
 		 90 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  hitchhiker  0.00000299463 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  40.7 
 
 		 90 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  40.7 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  40.91 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  40.91 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09623  probable DNA-binding protein HU  37.5 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.355669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2505  histone family protein DNA-binding protein  42.05 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791734  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5039  histone family protein DNA-binding protein  38.64 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  43.18 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3327  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.0697763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  40.91 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3249  histone-like DNA-binding protein  40.91 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4401  nucleoid protein HU alpha subunit  40.91 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.177499 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  43.02 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0160  histone family protein DNA-binding protein  40.86 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.982339  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1251  histone family protein DNA-binding protein  41.86 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0902596  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2903  histone family protein DNA-binding protein  41.86 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00933352  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  37.93 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  43.18 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  38.64 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>