48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0551 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2419  putative histone H1  100 
 
 
140 aa  254  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1880  DNA-binding protein BpH2  100 
 
 
140 aa  254  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2281  putative histone H1  100 
 
 
140 aa  254  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1671  DNA-binding protein BpH2  100 
 
 
140 aa  254  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.412961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0551  histone H1  100 
 
 
140 aa  254  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1700  DNA-binding protein BpH2  99.29 
 
 
147 aa  253  8e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791918  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0746  DNA-binding protein BpH2  99.29 
 
 
147 aa  253  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.73636  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0701  DNA-binding protein BpH2  98.08 
 
 
147 aa  200  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4602  histone family protein DNA-binding protein  97.12 
 
 
147 aa  197  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670627  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3872  histone family protein DNA-binding protein  96.08 
 
 
149 aa  192  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3550  histone family protein DNA-binding protein  96.08 
 
 
149 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108328  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4388  histone-like DNA-binding protein  96.08 
 
 
149 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.294948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2106  histone-like DNA-binding protein  96.08 
 
 
149 aa  192  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4509  histone family protein DNA-binding protein  80 
 
 
150 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0180118  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4442  histone family protein DNA-binding protein  80.37 
 
 
150 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0762  Bph2  80.95 
 
 
150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0912566  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4051  histone-like DNA-binding protein  73.79 
 
 
154 aa  157  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4510  histone family protein DNA-binding protein  76 
 
 
155 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43063  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4742  histone-like DNA-binding protein  72.55 
 
 
230 aa  153  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039459  normal  0.060583 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7384  histone family protein DNA-binding protein  73.68 
 
 
147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.283987 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5068  histone family protein DNA-binding protein  70.59 
 
 
135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5164  histone family protein DNA-binding protein  68.32 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1500  histone family protein DNA-binding protein  68.32 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0444762  normal  0.010023 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5992  histone-like DNA-binding protein  65.35 
 
 
202 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3889  histone family protein DNA-binding protein  74 
 
 
139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.933734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3162  histone family protein DNA-binding protein  74 
 
 
139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2126  histone family protein DNA-binding protein  67.65 
 
 
134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.598787  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1589  histone family protein DNA-binding protein  68.63 
 
 
179 aa  134  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.647783  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6090  histone-like bacterial DNA-binding protein (Bph2)  62.75 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000417993  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5558  histone-like DNA-binding protein  62.38 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6191  histone-like DNA-binding protein  61.39 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442446  hitchhiker  0.00020029 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1029  histone-like protein  56.6 
 
 
130 aa  122  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.221489  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0905  histone family protein DNA-binding protein  56.6 
 
 
130 aa  122  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1007  histone family protein DNA-binding protein  60.4 
 
 
132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.402804 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2662  histone-like protein  61.76 
 
 
157 aa  101  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.128126  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01988  DNA-binding protein  50.5 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.864367  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0911  DNA-binding protein HU, putative  45.63 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000732094  decreased coverage  0.000000096145 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0251  DNA-binding protein  45.38 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000057612  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1943  DNA-binding protein BpH2  44.62 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773845  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0581  DNA-binding protein BpH2  41.41 
 
 
129 aa  77  0.00000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1603  DNA-binding protein  41.41 
 
 
129 aa  77  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.53335  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2924  histone family protein DNA-binding protein  45.16 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0054  histone family protein DNA-binding protein  41.67 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.905154  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1452  histone-like DNA-binding protein  42.27 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14886  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1203  histone-like DNA-binding protein  41.24 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4034  DNA-binding protein HU  39.39 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.235716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3750  histone-like DNA-binding protein  37.11 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0653422  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0082  histone-like DNA-binding protein  33.67 
 
 
98 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>